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CoV-AbDab: the coronavirus antibody database
Bioinformatics, 2021-05, Vol.37 (5), p.734-735
2021
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Interactive visualisation of nanopore sequencing signal data with Squigualiser
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-08, Vol.40 (8)
2024
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popDMS infers mutation effects from deep mutational scanning data
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-08, Vol.40 (8)
2024
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Locuaz: An in-silico platform for protein binders optimization
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-08, Vol.40 (8)
2024
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Accelerated dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing data with fastglmpca
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-08, Vol.40 (8)
2024
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GRIEVOUS: your command-line general for resolving cross-dataset genotype inconsistencies
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-08, Vol.40 (8)
2024
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Epigenomics coverage data extraction and aggregation in R with tidyCoverage
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-08, Vol.40 (8)
2024
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AssemblyQC: A Nextflow pipeline for reproducible reporting of assembly quality
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-07, Vol.40 (8)
2024
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RawHash2: Mapping Raw Nanopore Signals Using Hash-Based Seeding and Adaptive Quantization
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-07, Vol.40 (8)
2024
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GUANIN: An all-in-one GUi-driven Analyzer for NanoString Interactive Normalization
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-07, Vol.40 (8)
2024
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SpatialQC: automated quality control for spatial transcriptome data
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-07, Vol.40 (8)
2024
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msproteomics sitereport: reporting DIA-MS phosphoproteomics experiments at site level with ease
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-07, Vol.40 (7)
2024
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iDeLUCS: a deep learning interactive tool for alignment-free clustering of DNA sequences
Bioinformatics (Oxford, England), 2023-09, Vol.39 (9)
2023
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GATK PathSeq: a customizable computational tool for the discovery and identification of microbial sequences in libraries from eukaryotic hosts
Bioinformatics, 2018-12, Vol.34 (24), p.4287-4289
2018
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Struct-f4: a Rcpp package for ancestry profile and population structure inference from f4-statistics
Bioinformatics, 2022-01, Vol.38 (7), p.2070-2071
2022
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A mass spectrometry‐based non‐radioactive differential radial capillary action of ligand assay (DRaCALA) to assess ligand binding to proteins
Journal of mass spectrometry., 2022-04, Vol.57 (4), p.e4822-n/a
2022
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  • BibTeX
Web interface for 3D visualization and analysis of SARS-CoV-2—human mimicry and interactions
Bioinformatics (Oxford, England), 2021-12
2021
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BANΔIT: B’‐Factor Analysis for Drug Design and Structural Biology
Molecular informatics, 2021-01, Vol.40 (1), p.e2000144-n/a
2021
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  • BibTeX
RNA-align: quick and accurate alignment of RNA 3D structures based on size-independent TM-scoreRNA
Bioinformatics, 2019-11, Vol.35 (21), p.4459-4461
2019
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SMARTS.plus – A Toolbox for Chemical Pattern Design
Molecular informatics, 2020-12, Vol.39 (12), p.e2000216-n/a
2020
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CovidGraph: a graph to fight COVID-19
Bioinformatics (Oxford, England), 2022-10, Vol.38 (20), p.4843-4845
2022
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Varmole: a biologically drop-connect deep neural network model for prioritizing disease risk variants and genes
Bioinformatics, 2021-07, Vol.37 (12), p.1772-1775
2021
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expam—high-resolution analysis of metagenomes using distance trees
Bioinformatics (Oxford, England), 2022-10, Vol.38 (20), p.4814-4816
2022
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Steer’n’Detect: fast 2D template detection with accurate orientation estimation
Bioinformatics, 2022-05, Vol.38 (11), p.3146-3148
2022
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NBLAST: a graphical user interface-based two-way BLAST software with a dot plot viewer
Genomics & informatics, 2022-09, Vol.20 (3), p.e40
2022
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