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19 Dubious Ways to Compute the Marginal Likelihood of a Phylogenetic Tree Topology
Systematic biology, 2020-03, Vol.69 (2), p.209
2020
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Species Delimitation using Genome-Wide SNP Data
Systematic biology, 2014-07, Vol.63 (4), p.534-542
2014
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Smooth Skyride through a Rough Skyline: Bayesian Coalescent-Based Inference of Population Dynamics
Molecular biology and evolution, 2008-07, Vol.25 (7), p.1459-1471
2008
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Detecting the Anomaly Zone in Species Trees and Evidence for a Misleading Signal in Higher-Level Skink Phylogeny (Squamata: Scincidae)
Systematic biology, 2016-05, Vol.65 (3), p.465-477
2016
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phylodyn: an R package for phylodynamic simulation and inference
Molecular ecology resources, 2017-01, Vol.17 (1), p.96-100
2017
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Marginal Likelihoods in Phylogenetics: A Review of Methods and Applications
Systematic biology, 2019-09, Vol.68 (5), p.681
2019
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Using Genotype Abundance to Improve Phylogenetic Inference
Molecular biology and evolution, 2018-05, Vol.35 (5), p.1253-1265
2018
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Learning to Count: Robust Estimates for Labeled Distances between Molecular Sequences
Molecular biology and evolution, 2009-04, Vol.26 (4), p.801-814
2009
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rbrothers: R Package for Bayesian Multiple Change-Point Recombination Detection
Evolutionary Bioinformatics, 2013-01, Vol.2013 (2013), p.235-238
2013
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Phylogeography of the Trans-Volcanic bunchgrass lizard (Sceloporus bicanthalis) across the highlands of south-eastern Mexico
Biological journal of the Linnean Society, 2013-12, Vol.110 (4), p.852-865
2013
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Measuring microsatellite conservation in mammalian evolution with a phylogenetic birth-death model
Genome biology and evolution, 2012-01, Vol.4 (6), p.636-647
2012
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Accounting for uncertainty in the tree topology has little effect on the decision-theoretic approach to model selection in phylogeny estimation
Molecular biology and evolution, 2005-03, Vol.22 (3), p.691-703
2005
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Bayesian nonparametric phylodynamics
Bayesian Phylogenetics, 2014, p.259-276
2014
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