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Bet hedging in yeast by heterogeneous, age-correlated expression of a stress protectant
PLoS biology, 2012-05, Vol.10 (5), p.e1001325-e1001325
2012
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Cellular Heterogeneity: Benefits Besides Bet-Hedging
Current biology, 2016-05, Vol.26 (9), p.R355-R357
2016
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Quantitative evolutionary dynamics using high-resolution lineage tracking
Nature (London), 2015-03, Vol.519 (7542), p.181-186
2015
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Single-cell copy number variant detection reveals the dynamics and diversity of adaptation
PLoS biology, 2018-12, Vol.16 (12), p.e3000069
2018
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Bartender: a fast and accurate clustering algorithm to count barcode reads
Bioinformatics, 2018-03, Vol.34 (5), p.739-747
2018
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Network hubs buffer environmental variation in Saccharomyces cerevisiae
PLoS biology, 2008-11, Vol.6 (11), p.e264-e264
2008
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A large accessory protein interactome is rewired across environments
eLife, 2020-09, Vol.9
2020
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The genotype-phenotype landscape of an allosteric protein
Molecular systems biology, 2021-03, Vol.17 (3), p.e10179-n/a
2021
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The interplay of additivity, dominance, and epistasis on fitness in a diploid yeast cross
Nature communications, 2022-03, Vol.13 (1), p.1463-1463, Article 1463
2022
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Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
PloS one, 2023-03, Vol.18 (3), p.e0283548-e0283548
2023
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Improved discovery of genetic interactions using CRISPRiSeq across multiple environments
Genome research, 2019-04, Vol.29 (4), p.668
2019
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The genotype‐phenotype landscape of an allosteric protein
Molecular systems biology, 2021-12, Vol.17 (12), p.e10847-n/a
2021
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iSeq: A New Double-Barcode Method for Detecting Dynamic Genetic Interactions in Yeast
G3 : genes - genomes - genetics, 2017-01, Vol.7 (1), p.143-153
2017
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A scalable double-barcode sequencing platform for characterization of dynamic protein-protein interactions
Nature communications, 2017-05, Vol.8 (1), p.15586-15586, Article 15586
2017
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Somatodendritic microRNAs identified by laser capture and multiplex RT-PCR
RNA (Cambridge), 2007-08, Vol.13 (8), p.1224-1234
2007
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Histone variant HTZ1 shows extensive epistasis with, but does not increase robustness to, new mutations
PLoS genetics, 2013-08, Vol.9 (8), p.e1003733-e1003733
2013
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A method for high‐throughput production of sequence‐verified DNA libraries and strain collections
Molecular systems biology, 2017-02, Vol.13 (2), p.913-n/a
2017
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Beyond genome sequencing: Lineage tracking with barcodes to study the dynamics of evolution, infection, and cancer
Genomics (San Diego, Calif.), 2014-12, Vol.104 (6), p.417-430
2014
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High-resolution lineage tracking reveals travelling wave of adaptation in laboratory yeast
Nature (London), 2019-11, Vol.575 (7783), p.494-499
2019
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Development of a Comprehensive Genotype-to-Fitness Map of Adaptation-Driving Mutations in Yeast
Cell, 2016-09, Vol.166 (6), p.1585-1596.e22
2016
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Gene Architectures that Minimize Cost of Gene Expression
Molecular cell, 2017-01, Vol.65 (1), p.142-153
2017
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Overdominant and partially dominant mutations drive clonal adaptation in diploid Saccharomyces cerevisiae
Genetics (Austin), 2022-05, Vol.221 (2)
2022
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Gene architectures that minimize cost of gene expression
Molecular cell, 2021-06, Vol.81 (11), p.2494-2494
2021
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Complex genetics cause and constrain fungal persistence in different parts of the mammalian body
Genetics (Austin), 2022-11, Vol.222 (3)
2022
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Unbiased Fitness Estimation of Pooled Barcode or Amplicon Sequencing Studies
Cell systems, 2018-11, Vol.7 (5), p.521-525.e4
2018
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