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New Glycoproteomics Software, GlycoPep Evaluator, Generates Decoy Glycopeptides de Novo and Enables Accurate False Discovery Rate Analysis for Small Data Sets
Analytical chemistry (Washington), 2014-09, Vol.86 (18), p.9212-9219
2014
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Characterizing O‑Linked Glycopeptides by Electron Transfer Dissociation: Fragmentation Rules and Applications in Data Analysis
Analytical chemistry (Washington), 2013-09, Vol.85 (17), p.8403-8411
2013
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Label-Free Quantitation: A New Glycoproteomics Approach
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2009-06, Vol.20 (6), p.1048-1059
2009
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The Aristotle Classifier: Using the Whole Glycomic Profile To Indicate a Disease State
Analytical chemistry (Washington), 2019-09, Vol.91 (17), p.11070-11077
2019
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Clinically Viable Assay for Monitoring Uromodulin Glycosylation
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2021-02, Vol.32 (2), p.436-443
2021
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Comparison of HPLC/ESI-FTICR MS Versus MALDI-TOF/TOF MS for Glycopeptide Analysis of a Highly Glycosylated HIV Envelope Glycoprotein
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2008-08, Vol.19 (8), p.1209-1220
2008
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Absolute Quantitation of Glycosylation Site Occupancy Using Isotopically Labeled Standards and LC-MS
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2014-06, Vol.25 (6), p.1012-1017
2014
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How to Apply Supervised Machine Learning Tools to MS Imaging Files: Case Study with Cancer Spheroids Undergoing Treatment with the Monoclonal Antibody Cetuximab
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2020-07, Vol.31 (7), p.1350-1357
2020
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The opportunity cost of automated glycopeptide analysis: case study profiling the SARS-CoV-2 S glycoprotein
Analytical and bioanalytical chemistry, 2021-12, Vol.413 (29), p.7215-7227
2021
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Method for Quantifying Oxidized Methionines and Application to HIV-1 Env
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2018-10, Vol.29 (10), p.2041-2047
2018
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Simplification of Mass Spectral Analysis of Acidic Glycopeptides Using GlycoPep ID
Analytical chemistry (Washington), 2007-04, Vol.79 (8), p.3065-3074
2007
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GlycoPep DB:  A Tool for Glycopeptide Analysis Using a “Smart Search”
Analytical chemistry (Washington), 2007-02, Vol.79 (4), p.1708-1713
2007
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HAMS: High-Affinity Mass Spectrometry Screening. A High-Throughput Screening Method for Identifying the Tightest-Binding Lead Compounds for Target Proteins with No False Positive Identifications
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2016-11, Vol.27 (11), p.1870-1877
2016
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GlycoPep Detector: A Tool for Assigning Mass Spectrometry Data of N‑Linked Glycopeptides on the Basis of Their Electron Transfer Dissociation Spectra
Analytical chemistry (Washington), 2013-05, Vol.85 (10), p.5023-5032
2013
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GlycoPep MassList: software to generate massive inclusion lists for glycopeptide analyses
Analytical and bioanalytical chemistry, 2017-01, Vol.409 (2), p.561-570
2017
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GlycoPep Grader: A Web-Based Utility for Assigning the Composition of N-Linked Glycopeptides
Analytical chemistry (Washington), 2012-06, Vol.84 (11), p.4821-4829
2012
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Simple Approach to Assign Disulfide Connectivity Using Extracted Ion Chromatograms of Electron Transfer Dissociation Spectra
Analytical chemistry (Washington), 2013-01, Vol.85 (2), p.1192-1199
2013
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Phosphonium labeling for increasing metabolomic coverage of neutral lipids using electrospray ionization mass spectrometry
Rapid communications in mass spectrometry, 2009-06, Vol.23 (12), p.1849-1855
2009
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Dissecting the dissociation patterns of fucosylated glycopeptides undergoing CID: a case study in improving automated glycopeptide analysis scoring algorithms
Analytical methods, 2018, Vol.1 (2), p.256-262
2018
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A General Protease Digestion Procedure for Optimal Protein Sequence Coverage and Post-Translational Modifications Analysis of Recombinant Glycoproteins: Application to the Characterization of Human Lysyl Oxidase-like 2 Glycosylation
Analytical chemistry (Washington), 2011-11, Vol.83 (22), p.8484-8491
2011
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Desorption/Ionization on Silicon Time-of-Flight/Time-of-Flight Mass Spectrometry
Analytical chemistry (Washington), 2003-05, Vol.75 (10), p.2504-2506
2003
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  • BibTeX
Maximizing Coverage of Glycosylation Heterogeneity in MALDI-MS Analysis of Glycoproteins with Up to 27 Glycosylation Sites
Analytical chemistry (Washington), 2008-05, Vol.80 (9), p.3144-3158
2008
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Disulfide Bond Characterization of Endogenous IgG3 Monoclonal Antibodies Using LC-MS: An Investigation of IgG3 Disulfide-mediated Isoforms
Analytical methods, 2016-08, Vol.8 (31), p.6046-6055
2016
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High Sensitivity and Analyte Capture with Desorption/Ionization Mass Spectrometry on Silylated Porous Silicon
Analytical chemistry (Washington), 2004-08, Vol.76 (15), p.4484-4489
2004
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Distinguishing Phosphorylation and Sulfation in Carbohydrates and Glycoproteins Using Ion-Pairing and Mass Spectrometry
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2006-09, Vol.17 (9), p.1282-1288
2006
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