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The robustness and innovability of protein folds
Current opinion in structural biology, 2014-06, Vol.26, p.131-138
2014
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Systematic Mapping of Protein Mutational Space by Prolonged Drift Reveals the Deleterious Effects of Seemingly Neutral Mutations
PLoS computational biology, 2015-08, Vol.11 (8), p.e1004421
2015
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Slow protein evolutionary rates are dictated by surface-core association
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011-07, Vol.108 (27), p.11151-11156
2011
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Disordered Proteinaceous Machines
Chemical reviews, 2014-07, Vol.114 (13), p.6806-6843
2014
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Disordered Tails of Homeodomains Facilitate DNA Recognition by Providing a Trade-Off between Folding and Specific Binding
Journal of the American Chemical Society, 2009-10, Vol.131 (42), p.15084-15085
2009
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An Ancient Fingerprint Indicates the Common Ancestry of Rossmann-Fold Enzymes Utilizing Different Ribose-Based Cofactors
PLoS biology, 2016-03, Vol.14 (3), p.e1002396-e1002396
2016
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Protein insertions and deletions enabled by neutral roaming in sequence space
Molecular biology and evolution, 2013-04, Vol.30 (4), p.761-771
2013
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Intrinsic Disorder in Ubiquitination Substrates
Journal of molecular biology, 2011-09, Vol.412 (3), p.319-324
2011
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Correlated occurrence and bypass of frame-shifting insertion-deletions (InDels) to give functional proteins
PLoS genetics, 2013-10, Vol.9 (10), p.e1003882
2013
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Hopeful (Protein InDel) Monsters?
Structure (London), 2014-06, Vol.22 (6), p.803-804
2014
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Malleable machines in transcription regulation: the mediator complex
PLoS computational biology, 2008-12, Vol.4 (12), p.e1000243-e1000243
2008
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Systematic Mapping of Protein Mutational Space by Prolonged Drift Reveals the Deleterious Effects of Seemingly Neutral Mutations: e1004421
PLoS computational biology, 2015-08, Vol.11 (8)
2015
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The origins and evolution of ubiquitination sites
Molecular bioSystems, 2012-07, Vol.8 (7), p.1865-1877
2012
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Correction to Disordered Proteinaceous Machines
Chemical reviews, 2015-04, Vol.115 (7), p.2780-2780
2015
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Correlated Occurrence and Bypass of Frame-Shifting Insertion-Deletions (InDels) to Give Functional Proteins: e1003882
PLoS genetics, 2013-10, Vol.9 (10)
2013
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The origins and evolution of ubiquitination sites
Molecular bioSystems, 2012, Vol.8 (7), p.1865
2012
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Phenotypic mutations contribute to protein diversity and shape protein evolution
Protein science, 2022-09, Vol.31 (9), p.e4397-n/a
2022
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The origins and evolution of ubiquitination sitesElectronic supplementary information (ESI) available. See DOI: 10.1039/c2mb25052g
2012-06
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Malleable machines in transcription regulation: the Mediator complex
Biophysical journal, 2009-02, Vol.96 (3), p.58a-58a
2009
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Structured States of Disordered Proteins from Genomic Sequences
Cell, 2016-09, Vol.167 (1), p.158-170.e12
2016
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The EVcouplings Python framework for coevolutionary sequence analysis
Bioinformatics (Oxford, England), 2019-05, Vol.35 (9), p.1582-1584
2019
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DeMAG predicts the effects of variants in clinically actionable genes by integrating structural and evolutionary epistatic features
Nature communications, 2023-04, Vol.14 (1), p.2230-2230, Article 2230
2023
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Malleable Machines in Transcription Regulation: The Mediator Complex: e1000243
PLoS computational biology, 2008-12, Vol.4 (12)
2008
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Environment modulates protein heterogeneity through transcriptional and translational stop codon readthrough
Nature communications, 2024-05, Vol.15 (1), p.4446-4446, Article 4446
2024
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Simple yet functional phosphate-loop proteins
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2018-12, Vol.115 (51), p.E11943-E11950
2018
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