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A catalogue of recombination coldspots in interspecific tomato hybrids
PLoS genetics, 2024-07, Vol.20 (7), p.e1011336
2024
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Prioritizing candidate eQTL causal genes in Arabidopsis using RANDOM FORESTS
G3 : genes - genomes - genetics, 2022-11, Vol.12 (11)
2022
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Domestication Shapes Recombination Patterns in Tomato
Molecular biology and evolution, 2022-01, Vol.39 (1)
2022
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Accelerated discovery of functional genomic variation in pigs
Genomics (San Diego, Calif.), 2021-07, Vol.113 (4), p.2229-2239
2021
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The Pectobacterium pangenome, with a focus on Pectobacterium brasiliense, shows a robust core and extensive exchange of genes from a shared gene pool
BMC genomics, 2021-04, Vol.22 (1), p.265-265, Article 265
2021
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Prior Biological Knowledge Improves Genomic Prediction of Growth-Related Traits in Arabidopsis thaliana
Frontiers in genetics, 2021-01, Vol.11, p.609117-609117
2021
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Chasing breeding footprints through structural variations in Cucumis melo and wild relatives
G3 : genes - genomes - genetics, 2021-01, Vol.11 (1)
2021
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Network Analysis Prioritizes DEWAX and ICE1 as the Candidate Genes for Major eQTL Hotspots in Seed Germination of Arabidopsis thaliana
G3 : genes - genomes - genetics, 2020-11, Vol.10 (11), p.4215-4226
2020
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Prioritizing sequence variants in conserved non-coding elements in the chicken genome using chCADD
PLoS genetics, 2020-09, Vol.16 (9), p.e1009027-e1009027
2020
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CAPICE: a computational method for Consequence-Agnostic Pathogenicity Interpretation of Clinical Exome variations
Genome medicine, 2020-08, Vol.12 (1), p.1-75, Article 75
2020
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pCADD: SNV prioritisation in Sus scrofa
Genetics selection evolution (Paris), 2020-02, Vol.52 (1), p.4-4, Article 4
2020
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Hecaton: reliably detecting copy number variation in plant genomes using short read sequencing data
BMC genomics, 2019-11, Vol.20 (1), p.818-818, Article 818
2019
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Family-Based Haplotype Estimation and Allele Dosage Correction for Polyploids Using Short Sequence Reads
Frontiers in genetics, 2019-04, Vol.10, p.335-335
2019
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Correcting palindromes in long reads after whole-genome amplification
BMC genomics, 2018-11, Vol.19 (1), p.798-798, Article 798
2018
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A survey of functional genomic variation in domesticated chickens
Genetics selection evolution (Paris), 2018-04, Vol.50 (1), p.17-17, Article 17
2018
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Genomics of Adaptation Depends on the Rate of Environmental Change in Experimental Yeast Populations
Molecular biology and evolution, 2017-10, Vol.34 (10), p.2613-2626
2017
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Heritable gene expression differences between apomictic clone members in Taraxacum officinale: Insights into early stages of evolutionary divergence in asexual plants
BMC genomics, 2016-03, Vol.17 (203), p.203-203, Article 203
2016
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The Genome of Winter Moth (Operophtera brumata) Provides a Genomic Perspective on Sexual Dimorphism and Phenology
Genome biology and evolution, 2015-07, Vol.7 (8), p.2321-2332
2015
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Beyond genomic variation--comparison and functional annotation of three Brassica rapa genomes: a turnip, a rapid cycling and a Chinese cabbage
BMC genomics, 2014-03, Vol.15 (1), p.250-250
2014
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How biochemical constraints of cellular growth shape evolutionary adaptations in metabolism
Genetics (Austin), 2013-06, Vol.194 (2), p.505-512
2013
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Gross Deletions Involving IGHM, BTK, or Artemis: A Model for Genomic Lesions Mediated by Transposable Elements
American journal of human genetics, 2008-02, Vol.82 (2), p.320-332
2008
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