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Superspreading events in the transmission dynamics of SARS-CoV-2: Opportunities for interventions and control
PLoS biology, 2020-11, Vol.18 (11), p.e3000897
2020
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Contributions from the silent majority dominate dengue virus transmission
PLoS pathogens, 2018-05, Vol.14 (5), p.e1006965
2018
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Detecting the impact of temperature on transmission of Zika, dengue, and chikungunya using mechanistic models
PLoS neglected tropical diseases, 2017-04, Vol.11 (4), p.e0005568-e0005568
2017
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The risk of sustained sexual transmission of Zika is underestimated
PLoS pathogens, 2017-09, Vol.13 (9), p.e1006633-e1006633
2017
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Ecological processes underlying the emergence of novel enzootic cycles: Arboviruses in the neotropics as a case study
PLoS neglected tropical diseases, 2020-08, Vol.14 (8), p.e0008338-e0008338
2020
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Forecasting Zika Incidence in the 2016 Latin America Outbreak Combining Traditional Disease Surveillance with Search, Social Media, and News Report Data
PLoS neglected tropical diseases, 2017-01, Vol.11 (1), p.e0005295-e0005295
2017
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Contact tracing performance during the Ebola epidemic in Liberia, 2014-2015
PLoS neglected tropical diseases, 2018-09, Vol.12 (9), p.e0006762-e0006762
2018
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Digital contact tracing and network theory to stop the spread of COVID-19 using big-data on human mobility geolocalization
PLoS computational biology, 2022-04, Vol.18 (4), p.e1009865-e1009865
2022
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Persistence of Yellow fever virus outside the Amazon Basin, causing epidemics in Southeast Brazil, from 2016 to 2018
PLoS neglected tropical diseases, 2018-06, Vol.12 (6), p.e0006538-e0006538
2018
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Role of three tick species in the maintenance and transmission of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus
PLoS neglected tropical diseases, 2020-06, Vol.14 (6), p.e0008368-e0008368
2020
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Mapping dengue risk in Singapore using Random Forest
PLoS neglected tropical diseases, 2018-06, Vol.12 (6), p.e0006587
2018
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OpenABM-Covid19-An agent-based model for non-pharmaceutical interventions against COVID-19 including contact tracing
PLoS computational biology, 2021-07, Vol.17 (7), p.e1009146-e1009146
2021
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Trends in SARS-CoV-2 infection prevalence during England's roadmap out of lockdown, January to July 2021
PLoS computational biology, 2022-11, Vol.18 (11), p.e1010724-e1010724
2022
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Reconstructing the course of the COVID-19 epidemic over 2020 for US states and counties: Results of a Bayesian evidence synthesis model
PLoS computational biology, 2022-08, Vol.18 (8), p.e1010465-e1010465
2022
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The multi-dimensional challenges of controlling respiratory virus transmission in indoor spaces: Insights from the linkage of a microscopic pedestrian simulation and SARS-CoV-2 transmission model
PLoS computational biology, 2024-03, Vol.20 (3), p.e1011956-e1011956
2024
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Optimizing COVID-19 testing strategies on college campuses: Evaluation of the health and economic costs
PLoS computational biology, 2023-12, Vol.19 (12), p.e1011715-e1011715
2023
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Data-driven contact structures: From homogeneous mixing to multilayer networks
PLoS computational biology, 2020-07, Vol.16 (7), p.e1008035-e1008035
2020
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Combining the dynamic model and deep neural networks to identify the intensity of interventions during COVID-19 pandemic
PLoS computational biology, 2023-10, Vol.19 (10), p.e1011535-e1011535
2023
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Novel modelling approaches to predict the role of antivirals in reducing influenza transmission
PLoS computational biology, 2023-01, Vol.19 (1), p.e1010797
2023
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Development of Accurate Long-lead COVID-19 Forecast
PLoS computational biology, 2023-07, Vol.19 (7), p.e1011278-e1011278
2023
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Estimating the contribution of HIV-infected adults to household pneumococcal transmission in South Africa, 2016-2018: A hidden Markov modelling study
PLoS computational biology, 2021-12, Vol.17 (12), p.e1009680-e1009680
2021
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A high-frequency mobility big-data reveals how COVID-19 spread across professions, locations and age groups
PLoS computational biology, 2023-04, Vol.19 (4), p.e1011083-e1011083
2023
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Revealing mechanisms of infectious disease spread through empirical contact networks
PLoS computational biology, 2021-12, Vol.17 (12), p.e1009604-e1009604
2021
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Towards a data-driven characterization of behavioral changes induced by the seasonal flu
PLoS computational biology, 2020-05, Vol.16 (5), p.e1007879-e1007879
2020
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Analysing pneumococcal invasiveness using Bayesian models of pathogen progression rates
PLoS computational biology, 2022-02, Vol.18 (2), p.e1009389-e1009389
2022
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