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Rapid and asymmetric divergence of duplicate genes in the human gene coexpression network
BMC bioinformatics, 2006-01, Vol.7 (1), p.46-46, Article 46
2006
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Web-based analysis of (Epi-) genome data using EpiGRAPH and Galaxy
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2010-01, Vol.628, p.275
2010
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Ten simple rules for reproducible computational research
PLoS computational biology, 2013-10, Vol.9 (10), p.e1003285-e1003285
2013
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Predicting runtimes of bioinformatics tools based on historical data: five years of Galaxy usage
Bioinformatics, 2019-09, Vol.35 (18), p.3453-3460
2019
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Manipulation of FASTQ data with Galaxy
Bioinformatics, 2010-07, Vol.26 (14), p.1783-1785
2010
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Galaxy CloudMan: delivering cloud compute clusters
BMC bioinformatics, 2010-12, Vol.11 Suppl 12 (S12), p.S4-S4, Article S4
2010
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Jupyter and Galaxy: Easing entry barriers into complex data analyses for biomedical researchers
PLoS computational biology, 2017-05, Vol.13 (5), p.e1005425-e1005425
2017
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StructureFold: genome-wide RNA secondary structure mapping and reconstruction in vivo
Bioinformatics, 2015-08, Vol.31 (16), p.2668-2675
2015
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Fast and accurate genome-wide predictions and structural modeling of protein-protein interactions using Galaxy
BMC bioinformatics, 2023-06, Vol.24 (1), p.263-263, Article 263
2023
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Making whole genome multiple alignments usable for biologists
Bioinformatics (Oxford, England), 2011-09, Vol.27 (17), p.2426-2428
2011
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Fostering accessible online education using Galaxy as an e-learning platform
PLoS computational biology, 2021-05, Vol.17 (5), p.e1008923-e1008923
2021
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Family reunion via error correction: an efficient analysis of duplex sequencing data
BMC bioinformatics, 2020-03, Vol.21 (1), p.96-96, Article 96
2020
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Integrative genomic analysis by interoperation of bioinformatics tools in GenomeSpace
Nature methods, 2016-03, Vol.13 (3), p.245
2016
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Wrangling Galaxy's reference data
Bioinformatics (Oxford, England), 2014-07, Vol.30 (13), p.1917-1919
2014
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A first look at ARFome: dual-coding genes in mammalian genomes
PLoS computational biology, 2007-05, Vol.3 (5), p.e91-e91
2007
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Controlling for contamination in re-sequencing studies with a reproducible web-based phylogenetic approach
BioTechniques, 2014-03, Vol.56 (3), p.134-141
2014
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