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Superspreading events in the transmission dynamics of SARS-CoV-2: Opportunities for interventions and control
PLoS biology, 2020-11, Vol.18 (11), p.e3000897
2020
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Forecasting Zika Incidence in the 2016 Latin America Outbreak Combining Traditional Disease Surveillance with Search, Social Media, and News Report Data
PLoS neglected tropical diseases, 2017-01, Vol.11 (1), p.e0005295-e0005295
2017
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Serotype-specific effectiveness against pneumococcal carriage and serotype replacement after ten-valent Pneumococcal Conjugate Vaccine (PCV10) introduction in Pakistan
PloS one, 2022-01, Vol.17 (1), p.e0262466-e0262466
2022
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Digital contact tracing and network theory to stop the spread of COVID-19 using big-data on human mobility geolocalization
PLoS computational biology, 2022-04, Vol.18 (4), p.e1009865-e1009865
2022
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Role of three tick species in the maintenance and transmission of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus
PLoS neglected tropical diseases, 2020-06, Vol.14 (6), p.e0008368-e0008368
2020
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Impact of temperature on the extrinsic incubation period of Zika virus in Aedes aegypti
PLoS neglected tropical diseases, 2020-03, Vol.14 (3), p.e0008047
2020
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eXplainable Artificial Intelligence (XAI) for the identification of biologically relevant gene expression patterns in longitudinal human studies, insights from obesity research
PLoS computational biology, 2020-04, Vol.16 (4), p.e1007792-e1007792
2020
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Reconstructing the course of the COVID-19 epidemic over 2020 for US states and counties: Results of a Bayesian evidence synthesis model
PLoS computational biology, 2022-08, Vol.18 (8), p.e1010465-e1010465
2022
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The multi-dimensional challenges of controlling respiratory virus transmission in indoor spaces: Insights from the linkage of a microscopic pedestrian simulation and SARS-CoV-2 transmission model
PLoS computational biology, 2024-03, Vol.20 (3), p.e1011956-e1011956
2024
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Detecting changes in generation and serial intervals under varying pathogen biology, contact patterns and outbreak response
PLoS computational biology, 2024-03, Vol.20 (3), p.e1011967-e1011967
2024
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Beyond ranking nodes: Predicting epidemic outbreak sizes by network centralities
PLoS computational biology, 2020-07, Vol.16 (7), p.e1008052-e1008052
2020
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Imaging with spatio-temporal modelling to characterize the dynamics of plant-pathogen lesions
PLoS computational biology, 2023-11, Vol.19 (11), p.e1011627-e1011627
2023
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Temperature modulates dengue virus epidemic growth rates through its effects on reproduction numbers and generation intervals
PLoS neglected tropical diseases, 2017-07, Vol.11 (7), p.e0005797
2017
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Time warping between main epidemic time series in epidemiological surveillance
PLoS computational biology, 2023-12, Vol.19 (12), p.e1011757-e1011757
2023
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Optimizing COVID-19 testing strategies on college campuses: Evaluation of the health and economic costs
PLoS computational biology, 2023-12, Vol.19 (12), p.e1011715-e1011715
2023
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Data-driven contact structures: From homogeneous mixing to multilayer networks
PLoS computational biology, 2020-07, Vol.16 (7), p.e1008035-e1008035
2020
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Prediction of opioid-related outcomes in a medicaid surgical population: Evidence to guide postoperative opiate therapy and monitoring
PLoS computational biology, 2023-08, Vol.19 (8), p.e1011376-e1011376
2023
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Combining the dynamic model and deep neural networks to identify the intensity of interventions during COVID-19 pandemic
PLoS computational biology, 2023-10, Vol.19 (10), p.e1011535-e1011535
2023
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Novel modelling approaches to predict the role of antivirals in reducing influenza transmission
PLoS computational biology, 2023-01, Vol.19 (1), p.e1010797
2023
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High-dimensional mediation analysis in survival models
PLoS computational biology, 2020-04, Vol.16 (4), p.e1007768
2020
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Estimating the contribution of HIV-infected adults to household pneumococcal transmission in South Africa, 2016-2018: A hidden Markov modelling study
PLoS computational biology, 2021-12, Vol.17 (12), p.e1009680-e1009680
2021
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Inferring the effective reproductive number from deterministic and semi-deterministic compartmental models using incidence and mobility data
PLoS computational biology, 2022-06, Vol.18 (6), p.e1010206-e1010206
2022
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A high-frequency mobility big-data reveals how COVID-19 spread across professions, locations and age groups
PLoS computational biology, 2023-04, Vol.19 (4), p.e1011083-e1011083
2023
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Revealing mechanisms of infectious disease spread through empirical contact networks
PLoS computational biology, 2021-12, Vol.17 (12), p.e1009604-e1009604
2021
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An ensemble forecast system for tracking dynamics of dengue outbreaks and its validation in China
PLoS computational biology, 2022-06, Vol.18 (6), p.e1010218-e1010218
2022
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