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DEEPScreen: high performance drug-target interaction prediction with convolutional neural networks using 2-D structural compound representations
Chemical science (Cambridge), 2020-03, Vol.11 (9), p.2531-2557
2020
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Abstract LB-A08: Differential alteration of IL-8 in response to Sorafenib and PI3K/Akt/mTOR inhibitors in liver cancer cells and in liver cancer stem cells
Molecular cancer therapeutics, 2018-01, Vol.17 (1_Supplement), p.LB-A08-LB-A08
2018
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iBioProVis: interactive visualization and analysis of compound bioactivity space
Bioinformatics, 2020-08, Vol.36 (14), p.4227-4230
2020
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Synthesis and cellular bioactivities of novel isoxazole derivatives incorporating an arylpiperazine moiety as anticancer agents
Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry, 2018-01, Vol.33 (1), p.1352-1361
2018
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iBioProVis: interactive visualization and analysis of compound bioactivity space
Bioinformatics, 2020-11, Vol.36 (17), p.4674-4674
2020
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Abstract 5235: In vitro validation of drug-target interactions revealed in silico by Comprehensive Resource of Biomedical Relations with Network Representations and Deep Learning (CROssBAR) in HCC
Cancer research (Chicago, Ill.), 2020-08, Vol.80 (16_Supplement), p.5235-5235
2020
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Abstract 3937: Differential alteration of IL-8 in liver cancer stem cell enrichment in response to PI3K/Akt/mTOR inhibitors and sorafenib
Cancer research (Chicago, Ill.), 2018-07, Vol.78 (13_Supplement), p.3937-3937
2018
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Human Hepatocellular Carcinoma Classification from H E Stained Histopathology Images with 3D Convolutional Neural Networks and Focal Loss Function
Journal of imaging, 2023-01, Vol.9 (2), p.25
2023
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DEEPScreen: high performance drug–target interaction prediction with convolutional neural networks using 2-D structural compound representations† †Electronic supplementary information (ESI) available. See DOI: 10.1039/c9sc03414e
Chemical science (Cambridge), 2020-01, Vol.11 (9), p.2531-2557
2020
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Effects of small molecule inhibitors on liver cancer stem cells in comparison with Sorafenib
The Turkish journal of gastroenterology, 2019-05, Vol.30 (Supp1), p.7-7
2019
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TGF-β Promotes Metabolic Reprogramming in Lung Fibroblasts via mTORC1-dependent ATF4 Activation
American journal of respiratory cell and molecular biology, 2020-11, Vol.63 (5), p.601-612
2020
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Crowdsourced mapping of unexplored target space of kinase inhibitors
Nature communications, 2021-06, Vol.12 (1), p.3307-18, Article 3307
2021
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Cytotoxic activities of some benzothiazole-piperazine derivatives
Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry, 2015-08, Vol.30 (4), p.649-654
2015
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SLPred: a multi-view subcellular localization prediction tool for multi-location human proteins
Bioinformatics, 2022-09, Vol.38 (17), p.4226-4229
2022
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Application of the Ugi reaction with multiple amino acid-derived components: synthesis and conformational evaluation of piperazine-based minimalist peptidomimetics
Organic & biomolecular chemistry, 2015-05, Vol.13 (17), p.4993-5005
2015
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Transfer learning for drug–target interaction prediction
Bioinformatics (Oxford, England), 2023-06, Vol.39 (Supplement_1), p.i103-i110
2023
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Design, synthesis and biological evaluation of novel 1,3-diarylpyrazoles as cyclooxygenase inhibitors, antiplatelet and anticancer agents
MedChemComm, 2018-05, Vol.9 (5), p.795-811
2018
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Synthesis of 3-aroyl-4-aryl-1-isopropylamino-4-piperidinols and evaluation of the cytotoxicities of the compounds against human hepatoma and breast cancer cell lines
Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry, 2015-08, Vol.30 (4), p.564-568
2015
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Synthesis and cytotoxicity studies of novel benzhydrylpiperazine carboxamide and thioamide derivatives
Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry, 2014-04, Vol.29 (2), p.205-214
2014
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3-Propionyl-thiazolidine-4-carboxylic acid ethyl esters: a family of antiproliferative thiazolidines
MedChemComm, 2015, Vol.6 (1), p.90-93
2015
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Vicinal Diaryl-Substituted Isoxazole and Pyrazole Derivatives with In Vitro Growth Inhibitory and In Vivo Antitumor Activity
ACS omega, 2022-10, Vol.7 (41), p.36206-36226
2022
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Quinoides and VEGFR2 TKIs influence the fate of hepatocellular carcinoma and its cancer stem cells
MedChemComm, 2017-01, Vol.8 (1), p.81-87
2017
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Synthesis of new N,N′-bis[1-aryl-3-(piperidine-1-yl)propylidene]hydrazine dihydrochlorides and evaluation of their cytotoxicity against human hepatoma and breast cancer cells
Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry, 2014-06, Vol.29 (3), p.420-426
2014
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A monoclonal antibody against DNA binding helix of p53 protein
Oncogene, 2001-03, Vol.20 (11), p.1398-1401
2001
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A signal transduction score flow algorithm for cyclic cellular pathway analysis, which combines transcriptome and ChIP-seq data
Molecular bioSystems, 2012-01, Vol.8 (12), p.3224-3231
2012
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