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DeepARG: a deep learning approach for predicting antibiotic resistance genes from metagenomic data
Microbiome, 2018-02, Vol.6 (1), p.23-23, Article 23
2018
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Effects of Dairy Manure-Based Amendments and Soil Texture on Lettuce- and Radish-Associated Microbiota and Resistomes
mSphere, 2019-05, Vol.4 (3)
2019
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MetaStorm: A Public Resource for Customizable Metagenomics Annotation
PloS one, 2016-09, Vol.11 (9), p.e0162442-e0162442
2016
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Apigenin Impacts the Growth of the Gut Microbiota and Alters the Gene Expression of Enterococcus
Molecules (Basel, Switzerland), 2017-08, Vol.22 (8), p.1292
2017
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MetaMLP: A Fast Word Embedding Based Classifier to Profile Target Gene Databases in Metagenomic Samples
Journal of computational biology, 2021-11, Vol.28 (11), p.1063
2021
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Identification of discriminatory antibiotic resistance genes among environmental resistomes using extremely randomized tree algorithm
Microbiome, 2019-08, Vol.7 (1), p.123-123, Article 123
2019
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An in-depth map of polyadenylation sites in cancer
Nucleic acids research, 2012-09, Vol.40 (17), p.8460
2012
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Secure coding practices in Java: challenges and vulnerabilities
2018 IEEE/ACM 40th International Conference on Software Engineering (ICSE), 2018, p.372-383
2018
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Comparison of Whole-Genome Sequences of Legionella pneumophila in Tap Water and in Clinical Strains, Flint, Michigan, USA, 2016
Emerging infectious diseases, 2019-11, Vol.25 (11), p.2013-2020
2019
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Triclosan has a robust, yet reversible impact on human gut microbial composition in vitro
PloS one, 2020-06, Vol.15 (6), p.e0234046-e0234046
2020
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A Pilot Study of Chicago Waterways as Reservoirs of Multidrug-Resistant Enterobacteriaceae (MDR-Ent) in a High-Risk Region for Community-Acquired MDR-Ent Infection in Children
Antimicrobial agents and chemotherapy, 2020-03, Vol.64 (4)
2020
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The effect of quercetin on genetic expression of the commensal gut microbes Bifidobacterium catenulatum, Enterococcus caccae and Ruminococcus gauvreauii
Anaerobe, 2016-12, Vol.42, p.130-141
2016
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Analysis of Temporal Changes in Growth and Gene Expression for Commensal Gut Microbes in Response to the Polyphenol Naringenin
Microbiology insights, 2018, Vol.11, p.1178636118775100-1178636118775100
2018
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Genome-wide transcript profiling reveals novel breast cancer-associated intronic sense RNAs
PloS one, 2015-03, Vol.10 (3), p.e0120296-e0120296
2015
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Demonstrating a Comprehensive Wastewater-Based Surveillance Approach That Differentiates Globally Sourced Resistomes
Environmental science & technology, 2022-11, Vol.56 (21), p.14982-14993
2022
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Enhanced GII.4 human norovirus infection in gnotobiotic pigs transplanted with a human gut microbiota
Journal of general virology, 2019-11, Vol.100 (11), p.1530-1540
2019
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Noncoding RNAs that associate with YB-1 alter proliferation in prostate cancer cells
RNA (Cambridge), 2015-06, Vol.21 (6), p.1159-1172
2015
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Metagenomic profiling of historic Colorado Front Range flood impact on distribution of riverine antibiotic resistance genes
Scientific reports, 2016-12, Vol.6 (1), p.38432-38432, Article 38432
2016
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Genome-Wide Transcript Profiling Reveals Novel Breast Cancer-Associated Intronic Sense RNAs: e0120296
PloS one, 2015-03, Vol.10 (3)
2015
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