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Targeting tRNA-synthetase interactions towards novel therapeutic discovery against eukaryotic pathogens
PLoS neglected tropical diseases, 2020-02, Vol.14 (2), p.e0007983
2020
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Prediction of regulatory targets of alternative isoforms of the epidermal growth factor receptor in a glioblastoma cell line
BMC bioinformatics, 2019-08, Vol.20 (1), p.434-434, Article 434
2019
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tRNA functional signatures classify plastids as late-branching cyanobacteria
BMC ecology and evolution, 2019-12, Vol.19 (1), p.224
2019
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Eye movements during listening reveal spontaneous grammatical processing
Frontiers in psychology, 2014-05, Vol.5, p.410-410
2014
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Structural and Genetic Determinants of Convergence in the Drosophila tRNA Structure–Function Map
Journal of molecular evolution, 2021-02, Vol.89 (1-2), p.103-116
2021
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The Louse-Borne Human Pathogen Bartonella quintana Is a Genomic Derivative of the Zoonotic Agent Bartonella henselae
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2004-06, Vol.101 (26), p.9716-9721
2004
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Dynamic regulation of mRNA decay during neural development
Neural development, 2015-04, Vol.10 (1), p.11-11, Article 11
2015
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tRNA signatures reveal a polyphyletic origin of SAR11 strains among alphaproteobacteria
PLoS computational biology, 2014-02, Vol.10 (2), p.e1003454-e1003454
2014
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FAST: FAST Analysis of Sequences Toolbox
Frontiers in genetics, 2015-05, Vol.6, p.172-172
2015
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tSFM 1.0: tRNA Structure–Function Mapper
Bioinformatics (Oxford, England), 2021-10, Vol.37 (20), p.3654-3656
2021
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Match fitness landscapes for macromolecular interaction networks: Selection for translational accuracy and rate can displace tRNA-binding interfaces of non-cognate aminoacyl-tRNA synthetases
Theoretical population biology, 2019-10, Vol.129, p.68-80
2019
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Initiator tRNA genes template the 3' CCA end at high frequencies in bacteria
BMC genomics, 2016-12, Vol.17 (1), p.1003-1003, Article 1003
2016
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No accident: genetic codes freeze in error-correcting patterns of the standard genetic code
Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B. Biological sciences, 2002-11, Vol.357 (1427), p.1625
2002
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The coevolution of genes and genetic codes: Crick's frozen accident revisited
Journal of molecular evolution, 2006-09, Vol.63 (3), p.297-313
2006
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CMCpy: Genetic Code-Message Coevolution Models in Python
Evolutionary Bioinformatics, 2013-01, Vol.2013 (2013), p.111-125
2013
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TFAM detects co-evolution of tRNA identity rules with lateral transfer of histidyl-tRNA synthetase
Nucleic acids research, 2006-01, Vol.34 (3), p.893
2006
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Transient Erythromycin Resistance Phenotype Associated with Peptidyl-tRNA Drop-Off on Early UGG and GGG Codons
Journal of Bacteriology, 2007-12, Vol.189 (24), p.8993-9000
2007
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TFAM 1.0: an online tRNA function classifier
Nucleic acids research, 2007-07, Vol.35 (Web Server issue), p.W350
2007
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Whole RNA-Sequencing and Transcriptome Assembly of Candida albicans and Candida africana under Chlamydospore-Inducing Conditions
Genome biology and evolution, 2017-07, Vol.9 (7), p.1971-1977
2017
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Intron Evolution and Information processing in the DNA polymerase alpha gene in spirotrichous ciliates: a hypothesis for interconversion between DNA and RNA deletion
Biology direct, 2007-02, Vol.2 (1), p.6-6
2007
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Visualizing bacterial tRNA identity determinants and antideterminants using function logos and inverse function logos
Nucleic acids research, 2006-01, Vol.34 (3), p.905
2006
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De novo search for non-coding RNA genes in the AT-rich genome of Dictyostelium discoideum: performance of Markov-dependent genome feature scoring
Genome Research, 2008-06, Vol.18 (6), p.888-899
2008
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New computational methods reveal tRNA identity element divergence between Proteobacteria and Cyanobacteria
Biochimie, 2007-10, Vol.89 (10), p.1276-1288
2007
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SCANMS: adjusting for multiple comparisons in sliding window neutrality tests
Bioinformatics, 2004-08, Vol.20 (12), p.1986-1988
2004
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On error minimization in a sequential origin of the standard genetic code
Journal of molecular evolution, 1998-07, Vol.47 (1), p.1-13
1998
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