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EasyCluster2: an improved tool for clustering and assembling long transcriptome reads
BMC bioinformatics, 2014, Vol.15 Suppl 15 (Suppl 15), p.S7-S7, Article S7
2014
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MBAT: a scalable informatics system for unifying digital atlasing workflows
BMC bioinformatics, 2010-12, Vol.11 (1), p.608-608, Article 608
2010
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FMAj: a tool for high content analysis of muscle dynamics in Drosophila metamorphosis
BMC bioinformatics, 2014, Vol.15 Suppl 16 (Suppl 16), p.S6-S6, Article S6
2014
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Mayday--integrative analytics for expression data
BMC bioinformatics, 2010-03, Vol.11 (1), p.121-121, Article 121
2010
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A highly efficient multi-core algorithm for clustering extremely large datasets
BMC bioinformatics, 2010-04, Vol.11 (1), p.169-169, Article 169
2010
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The MOLGENIS toolkit: rapid prototyping of biosoftware at the push of a button
BMC bioinformatics, 2010-12, Vol.11 Suppl 12 (S12), p.S12-S12, Article S12
2010
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Web tools for large-scale 3D biological images and atlases
BMC bioinformatics, 2012-06, Vol.13 (1), p.122-122, Article 122
2012
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Enrichr: interactive and collaborative HTML5 gene list enrichment analysis tool
BMC bioinformatics, 2013-04, Vol.14 (1), p.128-128, Article 128
2013
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Improving ontologies by automatic reasoning and evaluation of logical definitions
BMC bioinformatics, 2011-10, Vol.12 (1), p.418-418, Article 418
2011
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metaX: a flexible and comprehensive software for processing metabolomics data
BMC bioinformatics, 2017-03, Vol.18 (1), p.183-183, Article 183
2017
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Differential analysis of combinatorial protein complexes with CompleXChange
BMC bioinformatics, 2019-06, Vol.20 (1), p.300-300, Article 300
2019
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ATAQS: A computational software tool for high throughput transition optimization and validation for selected reaction monitoring mass spectrometry
BMC bioinformatics, 2011-03, Vol.12 (1), p.78-78, Article 78
2011
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CLEAN: CLustering Enrichment ANalysis
BMC bioinformatics, 2009-07, Vol.10 (1), p.234-234, Article 234
2009
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An efficient method for mining cross-timepoint gene regulation sequential patterns from time course gene expression datasets
BMC bioinformatics, 2013-09, Vol.14 Suppl 12 (S12), p.S3-S3, Article S3
2013
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GeneTonic: an R/Bioconductor package for streamlining the interpretation of RNA-seq data
BMC bioinformatics, 2021-12, Vol.22 (1), p.610-610, Article 610
2021
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Immunoinformatics-aided design of a new multi-epitope vaccine adjuvanted with domain 4 of pneumolysin against Streptococcus pneumoniae strains
BMC bioinformatics, 2023-02, Vol.24 (1), p.67-67, Article 67
2023
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SPARTA: Simple Program for Automated reference-based bacterial RNA-seq Transcriptome Analysis
BMC bioinformatics, 2016-02, Vol.17 (44), p.66-66, Article 66
2016
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The KUPNetViz: a biological network viewer for multiple -omics datasets in kidney diseases
BMC bioinformatics, 2013-07, Vol.14 (1), p.235-235, Article 235
2013
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MetaPIGA v2.0: maximum likelihood large phylogeny estimation using the metapopulation genetic algorithm and other stochastic heuristics
BMC bioinformatics, 2010-07, Vol.11 (1), p.379-379, Article 379
2010
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Reducing bias in RNA sequencing data: a novel approach to compute counts
BMC bioinformatics, 2014, Vol.15 Suppl 1 (S1), p.S7-S7, Article S7
2014
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PGA: an R/Bioconductor package for identification of novel peptides using a customized database derived from RNA-Seq
BMC bioinformatics, 2016-06, Vol.17 (1), p.244-244, Article 244
2016
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Comprior: facilitating the implementation and automated benchmarking of prior knowledge-based feature selection approaches on gene expression data sets
BMC bioinformatics, 2021-08, Vol.22 (1), p.1-401, Article 401
2021
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DIPSBC - data integration platform for systems biology collaborations
BMC bioinformatics, 2012-05, Vol.13 (1), p.85-85, Article 85
2012
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Evaluation of high-throughput isomiR identification tools: illuminating the early isomiRome of Tribolium castaneum
BMC bioinformatics, 2017-08, Vol.18 (1), p.359-359, Article 359
2017
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rapidGSEA: Speeding up gene set enrichment analysis on multi-core CPUs and CUDA-enabled GPUs
BMC bioinformatics, 2016-09, Vol.17 (1), p.394-394, Article 394
2016
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