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BEAST 2: a software platform for Bayesian evolutionary analysis
PLoS computational biology, 2014-04, Vol.10 (4), p.e1003537
2014
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MDHGI: Matrix Decomposition and Heterogeneous Graph Inference for miRNA-disease association prediction
PLoS computational biology, 2018-08, Vol.14 (8), p.e1006418-e1006418
2018
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Correction: Effects of Darwinian Selection and Mutability on Rate of Broadly Neutralizing Antibody Evolution during HIV-1 Infection
PLoS computational biology, 2019-06, Vol.15 (6), p.e1007138-e1007138
2019
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Emergence of spatial structure in cell groups and the evolution of cooperation
PLoS computational biology, 2010-03, Vol.6 (3), p.e1000716-e1000716
2010
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Most Undirected Random Graphs Are Amplifiers of Selection for Birth-Death Dynamics, but Suppressors of Selection for Death-Birth Dynamics
PLoS computational biology, 2015-11, Vol.11 (11), p.e1004437-e1004437
2015
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Environmental influence on the evolution of morphological complexity in machines
PLoS computational biology, 2014-01, Vol.10 (1), p.e1003399-e1003399
2014
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The AmP project: Comparing species on the basis of dynamic energy budget parameters
PLoS computational biology, 2018-05, Vol.14 (5), p.e1006100-e1006100
2018
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Evolutionary establishment of moral and double moral standards through spatial interactions
PLoS computational biology, 2010-04, Vol.6 (4), p.e1000758-e1000758
2010
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A neural network model for the evolution of learning in changing environments
PLoS computational biology, 2024-01, Vol.20 (1), p.e1011840-e1011840
2024
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Evolution of Self-Organized Task Specialization in Robot Swarms
PLoS computational biology, 2015-08, Vol.11 (8), p.e1004273-e1004273
2015
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Evolution of bow-tie architectures in biology
PLoS computational biology, 2015-03, Vol.11 (3), p.e1004055-e1004055
2015
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Evolutionary game dynamics in populations with heterogenous structures
PLoS computational biology, 2014-04, Vol.10 (4), p.e1003567-e1003567
2014
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Collective predator evasion: Putting the criticality hypothesis to the test
PLoS computational biology, 2021-03, Vol.17 (3), p.e1008832-e1008832
2021
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How evolution learns to generalise: Using the principles of learning theory to understand the evolution of developmental organisation
PLoS computational biology, 2017-04, Vol.13 (4), p.e1005358-e1005358
2017
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Asymmetric Evolutionary Games
PLoS computational biology, 2015-08, Vol.11 (8), p.e1004349-e1004349
2015
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Evolving generalists in switching rugged landscapes
PLoS computational biology, 2019-10, Vol.15 (10), p.e1007320-e1007320
2019
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Bet-hedging strategies in expanding populations
PLoS computational biology, 2019-04, Vol.15 (4), p.e1006529-e1006529
2019
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Ecological and evolutionary dynamics of cell-virus-virophage systems
PLoS computational biology, 2024-02, Vol.20 (2), p.e1010925-e1010925
2024
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Evolutionary graph theory beyond pairwise interactions: Higher-order network motifs shape times to fixation in structured populations
PLoS computational biology, 2024-03, Vol.20 (3), p.e1011905-e1011905
2024
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Protein ensembles link genotype to phenotype
PLoS computational biology, 2019-06, Vol.15 (6), p.e1006648-e1006648
2019
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Bias in the arrival of variation can dominate over natural selection in Richard Dawkins's biomorphs
PLoS computational biology, 2024-03, Vol.20 (3), p.e1011893-e1011893
2024
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Self-replicating artificial neural networks give rise to universal evolutionary dynamics
PLoS computational biology, 2024-03, Vol.20 (3), p.e1012004-e1012004
2024
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Specialization can drive the evolution of modularity
PLoS computational biology, 2010-03, Vol.6 (3), p.e1000719-e1000719
2010
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Transient amplifiers of selection and reducers of fixation for death-Birth updating on graphs
PLoS computational biology, 2020-01, Vol.16 (1), p.e1007529-e1007529
2020
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The evolutionary origins of Lévy walk foraging
PLoS computational biology, 2017-10, Vol.13 (10), p.e1005774-e1005774
2017
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