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Specific Protein Database Creation from Transcriptomics Data in Nonmodel Species: Holm Oak (Quercus ilex L.)
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2020, Vol.2139, p.57
2020
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UniProtKB/Swiss-Prot, the Manually Annotated Section of the UniProt KnowledgeBase: How to Use the Entry View
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2016-01, Vol.1374, p.23
2016
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Investigation of protein quaternary structure via stoichiometry and symmetry information
PloS one, 2018-06, Vol.13 (6), p.e0197176-e0197176
2018
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Trendspotting in the Protein Data Bank
FEBS letters, 2013-04, Vol.587 (8), p.1036-1045
2013
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Hard data
Nature (London), 2014-05, Vol.509 (7500), p.260-260
2014
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Correcting the record of structural publications requires joint effort of the community and journal editors
The FEBS journal, 2016-12, Vol.283 (24), p.4452-4457
2016
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Proteomics Standards Initiative: Fifteen Years of Progress and Future Work
Journal of proteome research, 2017-12, Vol.16 (12), p.4288-4298
2017
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ProbCons: Probabilistic consistency-based multiple sequence alignment
Genome research, 2005-02, Vol.15 (2), p.330
2005
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ProForma: A Standard Proteoform Notation
Journal of proteome research, 2018-03, Vol.17 (3), p.1321-1325
2018
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Knowledge-based analysis of proteomics data
BMC bioinformatics, 2012-11, Vol.13 Suppl 16 (S16), p.S13-S13, Article S13
2012
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Statistical Approach to Protein Quantification
Molecular & cellular proteomics, 2014-02, Vol.13 (2), p.666-677
2014
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Growth of novel protein structural data
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2007-02, Vol.104 (9), p.3183-3188
2007
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Structure-based protein function prediction using graph convolutional networks
Nature communications, 2021-05, Vol.12 (1), p.3168-3168, Article 3168
2021
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CATH: increased structural coverage of functional space
Nucleic acids research, 2021-01, Vol.49 (D1), p.D266
2021
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The cytochrome p450 homepage
Human genomics, 2009-10, Vol.4 (1), p.59-65, Article 59
2009
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FunSpec: a web-based cluster interpreter for yeast
BMC bioinformatics, 2002-11, Vol.3 (1), p.35-35, Article 35
2002
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Protein database searches using compositionally adjusted substitution matrices
The FEBS journal, 2005-10, Vol.272 (20), p.5101-5109
2005
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A curated gluten protein sequence database to support development of proteomics methods for determination of gluten in gluten-free foods
Journal of proteomics, 2017-06, Vol.163, p.67-75
2017
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PrePCI: A structure‐ and chemical similarity‐informed database of predicted protein compound interactions
Protein science, 2023-04, Vol.32 (4), p.e4594-n/a
2023
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Current two-dimensional electrophoresis technology for proteomics
Proteomics (Weinheim), 2004-12, Vol.4 (12), p.3665-3685
2004
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SpliceProt 2.0: A Sequence Repository of Human, Mouse, and Rat Proteoforms
International journal of molecular sciences, 2024-01, Vol.25 (2), p.1183
2024
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Profiling of 3696 Nuclear Receptor-Coregulator Interactions: A Resource for Biological and Clinical Discovery
Endocrinology (Philadelphia), 2018-06, Vol.159 (6), p.2397-2407
2018
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Generalized fragment picking in Rosetta: design, protocols and applications
PloS one, 2011-08, Vol.6 (8), p.e23294-e23294
2011
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The history of the CATH structural classification of protein domains
Biochimie, 2015-12, Vol.119, p.209-217
2015
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DbStRiPs: Database of structural repeats in proteins
Protein science, 2022-01, Vol.31 (1), p.23-36
2022
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