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Visualizing next-generation sequencing data with JBrowse
Ist Teil von
Briefings in bioinformatics, 2013-03, Vol.14 (2), p.172-177
Ort / Verlag
England: Oxford Publishing Limited (England)
Erscheinungsjahr
2013
Link zum Volltext
Quelle
EBSCOhost Business Source Ultimate
Beschreibungen/Notizen
JBrowse is a web-based genome browser, allowing many sources of data to be visualized, interpreted and navigated in a coherent visual framework. JBrowse uses efficient data structures, pre-generation of image tiles and client-side rendering to provide a fast, interactive browsing experience. Many of JBrowse's design features make it well suited for visualizing high-volume data, such as aligned next-generation sequencing reads.