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Details

Autor(en) / Beteiligte
Titel
Genetic diversity among Brazilian soybean cultivars based on SSR loci and pedigree data
Ist Teil von
  • Brazilian archives of biology and technology, 2010-06, Vol.53 (3), p.519-531
Ort / Verlag
Tecpar
Erscheinungsjahr
2010
Link zum Volltext
Quelle
EZB Free E-Journals
Beschreibungen/Notizen
  • In this study, simple sequence repeats (SSR) loci and pedigree data were used to investigate the genetic relationship in a group of 168 Brazilian soybean cultivars. Eighteen SSR loci produced an average of 5.06 alleles and a mean gene diversity of 0.58 for the cultivars studied. Genetic distance (GD) was determined using the modified Roger's Wright distance, and a final dendrogram was in agreement with the cultivar pedigree. A distance matrix based on the coefficient of parentage scores was also generated for the cultivars, which ranged from 0 to 1, with a mean of 0.18, whereas SSR-based genetic similarity (1- GD) ranged from 0.01 to 0.90, with a mean of 0.25. Mantel's Z test showed that the similarity matrices generated from both the data sets were low, but significantly correlated (r = 0.31, p<0.001). The results showed that SSR data and pedigree analyses could help to quantify more accurately the degree of relationship among the soybean cultivars. Locos microssatélites e dados de genealogia foram utilizados para avaliar a diversidade genética de um grupo de 168 cultivares brasileiras de soja. Os dezoito locos utilizados apresentaram em média 5,06 alelos por loco e coeficiente de diversidade genética médio de 0,58. O dendrograma final resultante da matriz de distância genética de Roger modificado por Wright, apresentou boa concordância com a ancestralidade dos grupos formados. Também foi estimado os coeficientes de parentesco entre as cultivares, sendo observada variação de 0 a 1 com média de 0,18, enquanto que as similaridades para os locos microssatélites (1- GD) variou de 0,01 a 0,90 com média de 0,25. A correlação entre as duas matrizes obtidas determinada pelo teste Z de Mantel apresentou valor baixo, 0,31, mas significativo (p<0,001). Os resultados obtidos sugerem que os locos microssatélites aliados às informações de genealogia proporcionam melhor análise da diversidade genética de cultivares de soja.
Sprache
Englisch
Identifikatoren
ISSN: 1516-8913
eISSN: 1516-8913, 1678-4324
DOI: 10.1590/S1516-89132010000300004
Titel-ID: cdi_doaj_primary_oai_doaj_org_article_1a03f6fc37184040879d2a8f68fa2085

Weiterführende Literatur

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