Das Fraunhofer IWES wurde am 1. Januar 2009 gegründet und ist aus dem Fraunhofer-Center für Windenergie und Meerestechnik CWMT in Bremerhaven sowie dem Institut für Solare Energieversorgungstechnik ISET e.V. in Kassel hervorgegangen. Vorstand und Senat der Fraunhofer-Gesellschaft beschlossen 2017, die Institutsteile ab Januar 2018 als eigenständige Institute fortzuführen: Das Fraunhofer IWES in Kassel wird zum neuen »Fraunhofer-Institut für Energiewirtschaft und Energiesystemtechnik IEE«. Das Fraunhofer IWES Nordwest mit Hauptsitz in Bremerhaven wird weiterhin mit dem Kürzel IWES und der leicht geänderten Institutsbezeichnung »Fraunhofer-Institut für Windenergiesysteme IWES« firmieren.