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Exploring microbial diversity and taxonomy using SSU rRNA hypervariable tag sequencing

PLoS genetics, 2008-11, Vol.4 (11), p.e1000255-e1000255

2008

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Epidemiology and Clinical Manifestations of Listeria monocytogenes Infection

Microbiology spectrum, 2019-05, Vol.7 (3)

2019

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Extensive transmission of microbes along the gastrointestinal tract

eLife, 2019-02, Vol.8

2019

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Comparative analysis of human gut microbiota by barcoded pyrosequencing

PloS one, 2008-07, Vol.3 (7), p.e2836-e2836

2008

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Gas Where It Shouldn't Be! Imaging Spectrum of Emphysematous Infections in the Abdomen and Pelvis

American journal of roentgenology (1976), 2021-03, Vol.216 (3), p.812

2021

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Widespread genomic signatures of natural selection in hominid evolution

PLoS genetics, 2009-05, Vol.5 (5), p.e1000471-e1000471

2009

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The microbiome in early life: implications for health outcomes

Nature medicine, 2016-07, Vol.22 (7), p.713-722

2016

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The diagnosis of chronic endometritis in infertile asymptomatic women: a comparative study of histology, microbial cultures, hysteroscopy, and molecular microbiology

American journal of obstetrics and gynecology, 2018-06, Vol.218 (6), p.602.e1-602.e16

2018

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A Dietary Fiber-Deprived Gut Microbiota Degrades the Colonic Mucus Barrier and Enhances Pathogen Susceptibility

Cell, 2016-11, Vol.167 (5), p.1339-1353.e21

2016

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Streptococcus pneumoniae : Invasion and Inflammation

Microbiology spectrum, 2019-03, Vol.7 (2)

2019

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Genomic diversity in autopsy samples reveals within-host dissemination of HIV-associated Mycobacterium tuberculosis

Nature medicine, 2016-12, Vol.22 (12), p.1470-1474

2016

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The role of bacterial biofilms in chronic infections

APMIS : acta pathologica, microbiologica et immunologica Scandinavica, 2013-05, Vol.121 (s136), p.1-58

Bjarnsholt, Thomas

2013

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An "Electronic Fluorescent Pictograph" browser for exploring and analyzing large-scale biological data sets

PloS one, 2007-08, Vol.2 (8), p.e718-e718

2007

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mixOmics: An R package for 'omics feature selection and multiple data integration

PLoS computational biology, 2017-11, Vol.13 (11), p.e1005752-e1005752

2017

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Microbial co-occurrence relationships in the human microbiome

PLoS computational biology, 2012-07, Vol.8 (7), p.e1002606-e1002606

2012

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Listeria monocytogenes-associated respiratory infections: a study of 38 consecutive cases

Clinical microbiology and infection, 2018-12, Vol.24 (12), p.1339.e1-1339.e5

2018

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Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in wildlife, food-producing, and companion animals: a systematic review

Clinical microbiology and infection, 2018-12, Vol.24 (12), p.1241-1250

2018

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Translocation and dissemination of commensal bacteria in post-stroke infection

Nature medicine, 2016-11, Vol.22 (11), p.1277-1284

2016

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The gut microbiota and host health: a new clinical frontier

Gut, 2016-02, Vol.65 (2), p.330-339

2016

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Bacteria from Diverse Habitats Colonize and Compete in the Mouse Gut

Cell, 2014-10, Vol.159 (2), p.253-266

2014

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Insight into microevolution of Yersinia pestis by clustered regularly interspaced short palindromic repeats

PloS one, 2008-07, Vol.3 (7), p.e2652-e2652

2008

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The microbial coinfection in COVID-19

Applied microbiology and biotechnology, 2020-09, Vol.104 (18), p.7777-7785

2020

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Ten years of pathway analysis: current approaches and outstanding challenges

PLoS computational biology, 2012-02, Vol.8 (2), p.e1002375-e1002375

2012

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