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High-throughput immune repertoire analysis with IGoR
Nature communications, 2018-02, Vol.9 (1), p.561-10, Article 561
2018
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Live Imaging of Bicoid-Dependent Transcription in Drosophila Embryos
Current biology, 2013-11, Vol.23 (21), p.2135-2139
2013
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Modeling and predicting the overlap of B- and T-cell receptor repertoires in healthy and SARS-CoV-2 infected individuals
PLoS genetics, 2023-02, Vol.19 (2), p.e1010652-e1010652
2023
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Genesis of the αβ T-cell receptor
PLoS computational biology, 2019-03, Vol.15 (3), p.e1006874-e1006874
2019
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Generation of Functional Human 3D Cortico-Motor Assembloids
Cell, 2020-12, Vol.183 (7), p.1913-1929.e26
2020
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North Pacific deglacial hypoxic events linked to abrupt ocean warming
Nature (London), 2015-11, Vol.527 (7578), p.362-366
2015
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Statistical mechanics for natural flocks of birds
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2012-03, Vol.109 (13), p.4786-4791
2012
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How a well-adapted immune system is organized
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2015-05, Vol.112 (19), p.5950-5955
2015
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Detecting T cell receptors involved in immune responses from single repertoire snapshots
PLoS biology, 2019-06, Vol.17 (6), p.e3000314-e3000314
2019
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Reliability of human cortical organoid generation
Nature methods, 2019-01, Vol.16 (1), p.75
2019
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Fluctuating fitness shapes the clone-size distribution of immune repertoires
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2016-01, Vol.113 (2), p.274-279
2016
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How a well-adapting immune system remembers
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2019-04, Vol.116 (18), p.8815-8823
2019
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Diversity of immune strategies explained by adaptation to pathogen statistics
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2016-08, Vol.113 (31), p.8630-8635
2016
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Social interactions dominate speed control in poising natural flocks near criticality
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2014-05, Vol.111 (20), p.7212-7217
2014
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Antigenic waves of virus-immune coevolution
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2021-07, Vol.118 (27), p.1
2021
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Inferring the immune response from repertoire sequencing
PLoS computational biology, 2020-04, Vol.16 (4), p.e1007873-e1007873
2020
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Statistical inference of the generation probability of T-cell receptors from sequence repertoires
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2012-10, Vol.109 (40), p.16161-16166
2012
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Information transmission in genetic regulatory networks: a review
Journal of physics. Condensed matter, 2011-04, Vol.23 (15), p.153102-31
2011
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Immune fingerprinting through repertoire similarity
PLoS genetics, 2021-01, Vol.17 (1), p.e1009301-e1009301
2021
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Building General Langevin Models from Discrete Datasets
Physical review. X, 2020-07, Vol.10 (3), p.031018, Article 031018
2020
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Quantifying selection in immune receptor repertoires
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2014-07, Vol.111 (27), p.9875-9880
2014
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Genetic diversity and the structure of genealogies in rapidly adapting populations
Genetics (Austin), 2013-02, Vol.193 (2), p.565-585
2013
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Maximum entropy models for antibody diversity
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2010-03, Vol.107 (12), p.5405-5410
2010
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A mechanism for hunchback promoters to readout morphogenetic positional information in less than a minute
eLife, 2020-07, Vol.9
2020
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Regulation of the adrenocortical stem cell niche: implications for disease
Nature reviews. Endocrinology, 2015-01, Vol.11 (1), p.14
2015
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