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Remarks on Autumn Conference 2021
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2022, Vol.20(4), pp.A51-A51
2022
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Theoretical Prediction of the Redox Potential of Catechins with First Principle Calculation
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2021, Vol.20(4), pp.137-139
2021
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How low-resolution structural data predict the conformational changes of a protein: a study on data-driven molecular dynamics simulationsElectronic supplementary information (ESI) available. See DOI: 10.1039/c8cp02246a
2018-07
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カスケード選択型分子動力学法によるタンパク質機能の動的秩序解析
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2018, Vol.17(1), pp.46-56
2018
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mutational analyses reveal different ligand-binding abilities of double pockets of medaka fish taste receptor type 1 essential for efficient taste recognition
Physical chemistry chemical physics : PCCP, 2021-09, Vol.23 (36), p.2398-245
2021
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Drug-discovery Simulation for Membrane Proteins
Seibutsu Butsuri, 2024, Vol.64(1), pp.21-24
2024
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分子動力学シミュレーションによる不凍タンパク質RiAFPの氷の結晶成長に及ぼす影響の解析
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2018, Vol.17(5), pp.222-224
2018
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光合成における酸素発生の反応機構
生物物理, 2018, Vol.58(3), pp.127-133
2018
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Programed dynamical ordering in self-organization processes of a nanocube: a molecular dynamics studyElectronic supplementary information (ESI) available. See DOI: 10.1039/c8cp00284c
2018-04
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Analyses on Dynamical Ordering of Protein Functions by Means of Cascade Selection Molecular Dynamics
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2018, Vol.17(1), pp.46-56
2018
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New insights into the oxidation process from neutron and X-ray crystal structures of an O-sensitive [NiFe]-hydrogenase
Chemical science (Cambridge), 2023-09, Vol.14 (35), p.936-9315
2023
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A computational scheme of pKa values based on the three-dimensional reference interaction site model self-consistent field theory coupled with the linear fitting correction schemeElectronic supplementary information (ESI) available. See DOI: 10.1039/c8cp04354j
2018-11
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2021秋季年会を終えて
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2022, Vol.20(4), pp.A51-A51
2022
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シトクロムcの複合体形成過程の再現シミュレーション
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2022, Vol.21(4), pp.134-136
2022
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脂質膜を考慮した膜タンパク質と化合物の複合体予測シミュレーション
生物物理, 2024, Vol.64(1), pp.21-24
2024
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Developments of Rare Event Sampling Methods for Proteins
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2019, Vol.18(5), pp.199-201
2019
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第一原理計算によるカテキンの酸化還元電位の理論予測
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2021, Vol.20(4), pp.137-139
2021
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有機分子触媒を用いたアミノ酸ラセミ化反応の理論的研究
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2022, Vol.21(4), pp.80-81
2022
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自由エネルギー反応経路探索法による水中アラニンペプチドの自由エネルギーネットワーク計算
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2019, Vol.18(5), pp.221-223
2019
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4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (HPPD)における金属活性中心の力場パラメータの構築とその評価
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2022, Vol.21(4), pp.82-84
2022
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レアイベントサンプリング法の開発と応用研究
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2019, Vol.18(5), pp.199-201
2019
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環状ペプチドの膜透過における溶媒和自由エネルギー計算
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2020, Vol.19(4), pp.125-127
2020
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Performance Benchmark of FMO Calculation with GPU-Accelerated Fock Matrix Preparation Routine
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2015, Vol.13(6), pp.323-324
2015
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GPU-accelerated FMO Calculation with OpenFMO: Four-Center Inter-Fragment Coulomb Interaction
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2015, Vol.14(3), pp.69-70
2015
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プロトン伝導性PVPA-xIm複合体のプロトン伝導機構の理論的解明
Journal of Computer Chemistry, Japan, 2020, Vol.19(4), pp.131-132
2020
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