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Microbial, host and xenobiotic diversity in the cystic fibrosis sputum metabolome
The ISME Journal, 2016-06, Vol.10 (6), p.1483-1498
2016
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Spatial distribution of microbial communities in the cystic fibrosis lung
The ISME Journal, 2012-02, Vol.6 (2), p.471-474
2012
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Sputum pathogen spectrum and clinical outcomes of upper respiratory tract infection in bronchiectasis exacerbation: a prospective cohort study
Emerging microbes & infections, 2023-12, Vol.12 (1), p.2202277-2202277
2023
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Association of bacterial community types, functional microbial processes and lung disease in cystic fibrosis airways
The ISME Journal, 2022-04, Vol.16 (4), p.905-914
2022
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CRISPR-based rapid and ultra-sensitive diagnostic test for Mycobacterium tuberculosis
Emerging microbes & infections, 2019-01, Vol.8 (1), p.1361-1369
2019
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Respiratory microbiota resistance and resilience to pulmonary exacerbation and subsequent antimicrobial intervention
The ISME Journal, 2016-05, Vol.10 (5), p.1081-1091
2016
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Lytic activity by temperate phages of Pseudomonas aeruginosa in long-term cystic fibrosis chronic lung infections
The ISME Journal, 2015-06, Vol.9 (6), p.1391-1398
2015
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Phylogenetic and metabolic diversity of bacteria associated with cystic fibrosis
The ISME Journal, 2011-01, Vol.5 (1), p.20-29
2011
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Partitioning core and satellite taxa from within cystic fibrosis lung bacterial communities
The ISME Journal, 2011-05, Vol.5 (5), p.780-791
2011
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Breath gas metabolites and bacterial metagenomes from cystic fibrosis airways indicate active pH neutral 2,3-butanedione fermentation
The ISME Journal, 2014-06, Vol.8 (6), p.1247-1258
2014
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A Winogradsky-based culture system shows an association between microbial fermentation and cystic fibrosis exacerbation
The ISME Journal, 2015-03, Vol.9 (4), p.1024-1038
2015
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Reducing bias in bacterial community analysis of lower respiratory infections
The ISME Journal, 2013-04, Vol.7 (4), p.697-706
2013
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Quorum-sensing signals indicate that cystic fibrosis lungs are infected with bacterial biofilms
Nature (London), 2000-10, Vol.407 (6805), p.762-764
2000
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Cointegration as a mechanism for the evolution of a KPC-producing multidrug resistance plasmid in Proteus mirabilis
Emerging microbes & infections, 2020-01, Vol.9 (1), p.1206-1218
2020
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Gloeostereum cimri, a novel shelf fungus isolated from a human pulmonary cyst
Emerging microbes & infections, 2020-01, Vol.9 (1), p.1114-1122
2020
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Just spit it out
Nature medicine, 2008-07, Vol.14 (7), p.706-709
2008
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Bacterial cis-2-unsaturated fatty acids found in the cystic fibrosis airway modulate virulence and persistence of Pseudomonas aeruginosa
The ISME Journal, 2012-05, Vol.6 (5), p.939-950
2012
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Multi-omic meta-analysis identifies functional signatures of airway microbiome in chronic obstructive pulmonary disease
The ISME Journal, 2020-11, Vol.14 (11), p.2748-2765
2020
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Inter-species interactions alter antibiotic efficacy in bacterial communities
The ISME Journal, 2022-03, Vol.16 (3), p.812-821
2022
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Allelic polymorphism shapes community function in evolving Pseudomonas aeruginosa populations
The ISME Journal, 2020-08, Vol.14 (8), p.1929-1942
2020
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Culture-enriched metagenomic sequencing enables in-depth profiling of the cystic fibrosis lung microbiota
Nature microbiology, 2020-02, Vol.5 (2), p.379
2020
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Alginate oligosaccharides enhance diffusion and activity of colistin in a mucin-rich environment
Scientific reports, 2022-03, Vol.12 (1), p.4986-4986, Article 4986
2022
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Microbiome networks and change-point analysis reveal key community changes associated with cystic fibrosis pulmonary exacerbations
NPJ biofilms and microbiomes, 2019-01, Vol.5 (1), p.4-4, Article 4
2019
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Complex and unexpected outcomes of antibiotic therapy against a polymicrobial infection
The ISME Journal, 2022-09, Vol.16 (9), p.2065-2075
2022
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Prolonged shedding of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 in patients with COVID-19
Emerging microbes & infections, 2020-01, Vol.9 (1), p.2571-2577
2020
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