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Phylogenomic analysis sheds light on the evolutionary pathways towards acoustic communication in Orthoptera
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BibTeX
Nature communications, 2020, Vol.11 (1), p.4939-4939
Song, Hojun
;
Béthoux, Olivier
;
Shin, Seunggwan
;
Donath, Alexander
;
Letsch, Harald
;
Liu, Shanlin
;
McKenna, Duane D
;
Meng, Guanliang
;
Misof, Bernhard
;
Podsiadlowski, Lars
;
Zhou, Xin
;
Wipfler, Benjamin
;
Simon, Sabrina
2020
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Diversity and evolution of the transposable element repertoire in arthropods with particular reference to insects
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BibTeX
BMC ecology and evolution, 2019, Vol.19 (1), p.1
Petersen, Malte
;
Armisén, David
;
Gibbs, Richard A.
;
Hering, Lars
;
Khila, Abderrahman
;
Mayer, Georg
;
Richards, Stephen
;
Niehuis, Oliver
;
Misof, Bernhard
2019
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Re-assessing the diversity of negative strand RNA viruses in insects
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BibTeX
PLoS pathogens, 2019, Vol.15 (12), p.e1008224-e1008224
Käfer, Simon
;
Paraskevopoulou, Sofia
;
Zirkel, Florian
;
Wieseke, Nicolas
;
Donath, Alexander
;
Petersen, Malte
;
Jones, Terry C
;
Liu, Shanlin
;
Zhou, Xin
;
Middendorf, Martin
;
Junglen, Sandra
;
Misof, Bernhard
;
Drosten, Christian
;
Jiggins, Francis Michael
2019
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The evolution and genomic basis of beetle diversity
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BibTeX
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2019, Vol.116 (49), p.24729-24737
McKenna, Duane D.
;
Shin, Seunggwan
;
Ahrens, Dirk
;
Balke, Michael
;
Beza-Beza, Cristian
;
Clarke, Dave J.
;
Donath, Alexander
;
Escalona, Hermes E.
;
Friedrich, Frank
;
Letsch, Harald
;
Liu, Shanlin
;
Maddison, David
;
Mayer, Christoph
;
Misof, Bernhard
;
Murin, Peyton J.
;
Niehuis, Oliver
;
Peters, Ralph S.
;
Podsiadlowski, Lars
;
Pohl, Hans
;
Scully, Erin D.
;
Yan, Evgeny V.
;
Zhou, Xin
;
Ślipiński, Adam
;
Beutel, Rolf G.
2019
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An integrative phylogenomic approach to elucidate the evolutionary history and divergence times of Neuropterida (Insecta: Holometabola)
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BibTeX
BMC ecology and evolution, 2020, Vol.20, p.1
Vasilikopoulos, Alexandros
;
Misof, Bernhard
;
Meusemann, Karen
;
Lieberz, Doria
;
Flouri, Tomáš
;
Beutel, Rolf G
;
Niehuis, Oliver
;
Wappler, Torsten
;
Rust, Jes
;
Peters, Ralph S
;
Donath, Alexander
;
Podsiadlowski, Lars
;
Mayer, Christoph
;
Bartel, Daniela
;
Böhm, Alexander
;
Liu, Shanlin
;
Kapli, Paschalia
;
Greve, Carola
;
Jepson, James E
;
Liu, Xingyue
;
Zhou, Xin
;
Aspöck, Horst
;
Aspöck, Ulrike
2020
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Phylogenomics reveals the evolutionary timing and pattern of butterflies and moths
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BibTeX
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2019, Vol.116 (45), p.22657-22663
Kawahara, Akito Y.
;
Plotkin, David
;
Espeland, Marianne
;
Meusemann, Karen
;
Toussaint, Emmanuel F. A.
;
Donath, Alexander
;
Gimnich, France
;
Frandsen, Paul B.
;
Zwick, Andreas
;
dos Reis, Mario
;
Barber, Jesse R.
;
Peters, Ralph S.
;
Liu, Shanlin
;
Zhou, Xin
;
Mayer, Christoph
;
Podsiadlowski, Lars
;
Storer, Caroline
;
Yack, Jayne E.
;
Misof, Bernhard
;
Breinholt, Jesse W.
2019
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Phylogenomics and the evolution of hemipteroid insects
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BibTeX
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2018, Vol.115 (50), p.12775-12780
Johnson, Kevin P.
;
Dietrich, Christopher H.
;
Friedrich, Frank
;
Beutel, Rolf G.
;
Wipfler, Benjamin
;
Peters, Ralph S.
;
Allen, Julie M.
;
Petersen, Malte
;
Donath, Alexander
;
Walden, Kimberly K. O.
;
Kozlov, Alexey M.
;
Podsiadlowski, Lars
;
Mayer, Christoph
;
Meusemann, Karen
;
Vasilikopoulos, Alexandros
;
Waterhouse, Robert M.
;
Cameron, Stephen L.
;
Weirauch, Christiane
;
Swanson, Daniel R.
;
Percy, Diana M.
;
Hardy, Nate B.
;
Terry, Irene
;
Liu, Shanlin
;
Zhou, Xin
;
Misof, Bernhard
;
Robertson, Hugh M.
;
Yoshizawa, Kazunori
2018
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Author Correction: Phylogenomic analysis sheds light on the evolutionary pathways towards acoustic communication in Orthoptera
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BibTeX
Nature communications, 2020, Vol.11 (1), p.5674-5674
Song, Hojun
;
Béthoux, Olivier
;
Shin, Seunggwan
;
Donath, Alexander
;
Letsch, Harald
;
Liu, Shanlin
;
McKenna, Duane D
;
Meng, Guanliang
;
Misof, Bernhard
;
Podsiadlowski, Lars
;
Zhou, Xin
;
Wipfler, Benjamin
;
Simon, Sabrina
2020
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Orthograph: a versatile tool for mapping coding nucleotide sequences to clusters of orthologous genes
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BibTeX
BMC bioinformatics, 2017, Vol.18 (1), p.111-111
Petersen, Malte
;
Meusemann, Karen
;
Donath, Alexander
;
Dowling, Daniel
;
Liu, Shanlin
;
Peters, Ralph S
;
Podsiadlowski, Lars
;
Vasilikopoulos, Alexandros
;
Zhou, Xin
;
Misof, Bernhard
;
Niehuis, Oliver
2017
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Genomic adaptations to aquatic and aerial life in mayflies and the origin of insect wings
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BibTeX
Nature communications, 2020, Vol.11 (1), p.2631-2631
Almudi, Isabel
;
Vizueta, Joel
;
Wyatt, Christopher D R
;
de Mendoza, Alex
;
Marlétaz, Ferdinand
;
Firbas, Panos N
;
Feuda, Roberto
;
Masiero, Giulio
;
Medina, Patricia
;
Alcaina-Caro, Ana
;
Cruz, Fernando
;
Gómez-Garrido, Jessica
;
Gut, Marta
;
Alioto, Tyler S
;
Vargas-Chavez, Carlos
;
Davie, Kristofer
;
Misof, Bernhard
;
González, Josefa
;
Aerts, Stein
;
Lister, Ryan
;
Paps, Jordi
;
Rozas, Julio
;
Sánchez-Gracia, Alejandro
;
Irimia, Manuel
;
Maeso, Ignacio
;
Casares, Fernando
2020
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Repertoire-wide gene structure analyses: a case study comparing automatically predicted and manually annotated gene models
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BibTeX
BMC genomics, 2019, Vol.20 (1), p.753-753
Wilbrandt, Jeanne
;
Misof, Bernhard
;
Panfilio, Kristen A
;
Niehuis, Oliver
2019
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Evolutionary history of Polyneoptera and its implications for our understanding of early winged insects
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BibTeX
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2019, Vol.116 (8), p.3024-3029
Wipfler, Benjamin
;
Letsch, Harald
;
Frandsen, Paul B.
;
Kapli, Paschalia
;
Mayer, Christoph
;
Bartel, Daniela
;
Buckley, Thomas R.
;
Donath, Alexander
;
Edgerly-Rooks, Janice S.
;
Fujita, Mari
;
Liu, Shanlin
;
Machida, Ryuichiro
;
Mashimo, Yuta
;
Misof, Bernhard
;
Niehuis, Oliver
;
Peters, Ralph S.
;
Petersen, Malte
;
Podsiadlowski, Lars
;
Schütte, Kai
;
Shimizu, Shota
;
Uchifune, Toshiki
;
Wilbrandt, Jeanne
;
Yan, Evgeny
;
Zhou, Xin
;
Simon, Sabrina
2019
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COGNATE: comparative gene annotation characterizer
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BibTeX
BMC genomics, 2017, Vol.18 (1), p.535-535
Wilbrandt, Jeanne
;
Misof, Bernhard
;
Niehuis, Oliver
2017
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An integrative phylogenomic approach illuminates the evolutionary history of cockroaches and termites (Blattodea)
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BibTeX
Proceedings of the Royal Society. B, Biological sciences, 2019, Vol.286 (1895), p.20182076-20182076
Evangelista, Dominic A
;
Wipfler, Benjamin
;
Béthoux, Olivier
;
Donath, Alexander
;
Fujita, Mari
;
Kohli, Manpreet K
;
Legene, Frédéric
;
Liu, Shanlin
;
Machida, Ryuichiro
;
Misof, Bernhard
;
Peters, Ralph S
;
Podsiadlowski, Lars
;
Rust, Jes
;
Schuette, Kai
;
Tollenaar, Ward
;
Ware, Jessica L
;
Wappler, Torsten
;
Zhou, Xin
;
Meusemann, Karen
;
Simon, Sabrina
2019
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Signatures of DNA Methylation across Insects Suggest Reduced DNA Methylation Levels in Holometabola
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BibTeX
Genome biology and evolution, 2018, Vol.10 (4), p.1185-1197
Provataris, Panagiotis
;
Meusemann, Karen
;
Niehuis, Oliver
;
Grath, Sonja
;
Misof, Bernhard
;
Wagner, Gunter
2018
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Selecting informative subsets of sparse supermatrices increases the chance to find correct trees
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BibTeX
BMC bioinformatics, 2013, Vol.14 (1), p.348-348
Misof, Bernhard
;
Meyer, Benjamin
;
von Reumont, Björn Marcus
;
Kück, Patrick
;
Misof, Katharina
;
Meusemann, Karen
2013
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Genomic signatures accompanying the dietary shift to phytophagy in polyphagan beetles
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BibTeX
Genome Biology, 2019, Vol.20 (1), p.98-14
Seppey, Mathieu
;
Ioannidis, Panagiotis
;
Emerson, Brent C
;
Pitteloud, Camille
;
Robinson-Rechavi, Marc
;
Roux, Julien
;
Escalona, Hermes E
;
McKenna, Duane D
;
Misof, Bernhard
;
Shin, Seunggwan
;
Zhou, Xin
;
Waterhouse, Robert M
;
Alvarez, Nadir
2019
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Long branch effects distort maximum likelihood phylogenies in simulations despite selection of the correct model
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BibTeX
PloS one, 2012, Vol.7 (5), p.e36593-e36593
Kück, Patrick
;
Mayer, Christoph
;
Wägele, Johann-Wolfgang
;
Misof, Bernhard
;
Stiller, John W.
2012
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Beyond Drosophila: resolving the rapid radiation of schizophoran flies with phylotranscriptomics
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BibTeX
BMC biology, 2021, Vol.19 (1), p.23-17
Bayless, Keith M
;
Trautwein, Michelle D
;
Meusemann, Karen
;
Shin, Seunggwan
;
Petersen, Malte
;
Donath, Alexander
;
Podsiadlowski, Lars
;
Mayer, Christoph
;
Niehuis, Oliver
;
Peters, Ralph S
;
Meier, Rudolf
;
Kutty, Sujatha Narayanan
;
Liu, Shanlin
;
Zhou, Xin
;
Misof, Bernhard
;
Yeates, David K
;
Wiegmann, Brian M
2021
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Four myriapod relatives – but who are sisters? No end to debates on relationships among the four major myriapod subgroups
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BMC ecology and evolution, 2020, Vol.20, p.1
Szucsich, Nikolaus U
;
Bartel, Daniela
;
Blanke, Alexander
;
Böhm, Alexander
;
Donath, Alexander
;
Fukui, Makiko
;
Grove, Simon
;
Liu, Shanlin
;
Macek, Oliver
;
Machida, Ryuichiro
;
Misof, Bernhard
;
Nakagaki, Yasutaka
;
Podsiadlowski, Lars
;
Sekiya, Kaoru
;
Tomizuka, Shigekazu
;
Von Reumont, Björn M
;
Waterhouse, Robert M
;
Walzl, Manfred
;
Meng, Guanliang
;
Zhou, Xin
;
Pass, Günther
;
Meusemann, Karen
2020
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Repeated trans-watershed hybridization among haplochromine cichlids (Cichlidae) was triggered by Neogene landscape evolution
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BibTeX
Proceedings of the Royal Society. B, Biological sciences, 2012, Vol.279 (1746), p.4389-4398
Schwarzer, Julia
;
Swartz, Ernst Roelof
;
Vreven, Emmanuel
;
Snoeks, Jos
;
Cotterill, Fenton Peter David
;
Misof, Bernhard
;
Schliewen, Ulrich Kurt
2012
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AliGROOVE--visualization of heterogeneous sequence divergence within multiple sequence alignments and detection of inflated branch support
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BibTeX
BMC bioinformatics, 2014, Vol.15 (1), p.294-294
Kück, Patrick
;
Meid, Sandra A
;
Groß, Christian
;
Wägele, Johann W
;
Misof, Bernhard
2014
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Parametric and non-parametric masking of randomness in sequence alignments can be improved and leads to better resolved trees
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BibTeX
Frontiers in zoology, 2010, Vol.7 (1), p.10-10
Kück, Patrick
;
Meusemann, Karen
;
Dambach, Johannes
;
Thormann, Birthe
;
von Reumont, Björn M
;
Wägele, Johann W
;
Misof, Bernhard
2010
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Decisive data sets in phylogenomics: lessons from studies on the phylogenetic relationships of primarily wingless insects
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BibTeX
Molecular biology and evolution, 2014, Vol.31 (1), p.239-249
Dell'Ampio, Emiliano
;
Meusemann, Karen
;
Szucsich, Nikolaus U
;
Peters, Ralph S
;
Meyer, Benjamin
;
Borner, Janus
;
Petersen, Malte
;
Aberer, Andre J
;
Stamatakis, Alexandros
;
Walzl, Manfred G
;
Minh, Bui Quang
;
von Haeseler, Arndt
;
Ebersberger, Ingo
;
Pass, Günther
;
Misof, Bernhard
2014
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Time and origin of cichlid colonization of the lower Congo rapids
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BibTeX
PloS one, 2011, Vol.6 (7), p.e22380-e22380
Schwarzer, Julia
;
Misof, Bernhard
;
Ifuta, Seraphin N
;
Schliewen, Ulrich K
;
Salamin, Nicolas
2011
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