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Proviruses with identical sequences comprise a large fraction of the replication-competent HIV reservoir
PLoS pathogens, 2017, Vol.13 (3), p.e1006283-e1006283
Bui, John K;Sobolewski, Michele D;Keele, Brandon F;Spindler, Jonathan;Musick, Andrew;Wiegand, Ann;Luke, Brian T;Shao, Wei;Hughes, Stephen H;Coffin, John M;Kearney, Mary F;Mellors, John W;Ross, Susan R.
2017
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Generation of Transmitted/Founder HIV-1 Infectious Molecular Clones and Characterization of Their Replication Capacity in CD4 T Lymphocytes and Monocyte-Derived Macrophages
Journal of Virology, 2012, Vol.86 (5), p.2715-2728
OCHSENBAUER, Christina;EDMONDS, Tara G;HAHN, Beatrice H;KAPPES, John C;HAITAO DING;KEELE, Brandon F;DECKER, Julie;SALAZAR, Maria G;SALAZAR-GONZALEZ, Jesus F;SHATTOCK, Robin;HAYNES, Barton F;SHAW, George M
2012
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Proliferation of latently infected CD4 + T cells carrying replication-competent HIV-1: Potential role in latent reservoir dynamics
The Journal of experimental medicine, 2017, Vol.214 (4), p.959-972
Hosmane, Nina N;Kwon, Kyungyoon J;Bruner, Katherine M;Capoferri, Adam A;Beg, Subul;Rosenbloom, Daniel I S;Keele, Brandon F;Ho, Ya-Chi;Siliciano, Janet D;Siliciano, Robert F
2017
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HIV-1 Vpu Mediates HLA-C Downregulation
Cell host & microbe, 2016, Vol.19 (5), p.686-695
Apps, Richard;Del Prete, Gregory Q.;Chatterjee, Pramita;Lara, Abigail;Brumme, Zabrina L.;Brockman, Mark A.;Neil, Stuart;Pickering, Suzanne;Schneider, Douglas K.;Piechocka-Trocha, Alicja;Walker, Bruce D.;Thomas, Rasmi;Shaw, George M.;Hahn, Beatrice H.;Keele, Brandon F.;Lifson, Jeffrey D.;Carrington, Mary
2016
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Limited or no protection by weakly or nonneutralizing antibodies against vaginal SHIV challenge of macaques compared with a strongly neutralizing antibody
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011, Vol.108 (27), p.11181-11186
Burton, Dennis R;Hessell, Ann J;Keele, Brandon F;Klasse, Per Johan;Ketas, Thomas A;Moldt, Brian;Dunlop, D. Cameron;Poignard, Pascal;Doyle, Lara A;Cavacini, Lisa;Veazey, Ronald S;Moore, John P
2011
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Origin of Rebound Plasma HIV Includes Cells with Identical Proviruses That Are Transcriptionally Active before Stopping of Antiretroviral Therapy
Journal of virology, 2016, Vol.90 (3), p.1369-1376
Kearney, Mary F;Wiegand, Ann;Shao, Wei;Coffin, John M;Mellors, John W;Lederman, Michael;Gandhi, Rajesh T;Keele, Brandon F;Li, Jonathan Z;Silvestri, G.
2016
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Adeno-Associated Virus Delivery of Anti-HIV Monoclonal Antibodies Can Drive Long-Term Virologic Suppression
Immunity (Cambridge, Mass.), 2019, Vol.50 (3), p.567-575.e5
Martinez-Navio, José M.;Fuchs, Sebastian P.;Pantry, Shara N.;Lauer, William A.;Duggan, Natasha N.;Keele, Brandon F.;Rakasz, Eva G.;Gao, Guangping;Lifson, Jeffrey D.;Desrosiers, Ronald C.
2019
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Inflammatory genital infections mitigate a severe genetic bottleneck in heterosexual transmission of subtype A and C HIV-1
PLoS pathogens, 2009, Vol.5 (1), p.e1000274-e1000274
Haaland, Richard E;Hawkins, Paulina A;Salazar-Gonzalez, Jesus;Johnson, Amber;Tichacek, Amanda;Karita, Etienne;Manigart, Olivier;Mulenga, Joseph;Keele, Brandon F;Shaw, George M;Hahn, Beatrice H;Allen, Susan A;Derdeyn, Cynthia A;Hunter, Eric;Trkola, Alexandra
2009
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African green monkeys avoid SIV disease progression by preventing intestinal dysfunction and maintaining mucosal barrier integrity
PLoS pathogens, 2020, Vol.16 (3), p.e1008333-e1008333
Raehtz, Kevin D.;Barrenäs, Fredrik;Xu, Cuiling;Busman-Sahay, Kathleen;Valentine, Audrey;Law, Lynn;Ma, Dongzhu;Policicchio, Benjamin B.;Wijewardana, Viskam;Brocca-Cofano, Egidio;Trichel, Anita;Gale, Michael;Keele, Brandon F.;Estes, Jacob D.;Apetrei, Cristian;Pandrea, Ivona;Evans, David T.
2020
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Wide Variation in the Multiplicity of HIV-1 Infection among Injection Drug Users
Journal of Virology, 2010, Vol.84 (12), p.6241-6247
Bar, Katharine J;Li, Hui;Chamberland, Annie;Tremblay, Cecile;Routy, Jean Pierre;Grayson, Truman;Sun, Chuanxi;Wang, Shuyi;Learn, Gerald H;Morgan, Charity J;Schumacher, Joseph E;Haynes, Barton F;Keele, Brandon F;Hahn, Beatrice H;Shaw, George M
2010
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Minimal Contribution of APOBEC3-Induced G-to-A Hypermutation to HIV-1 Recombination and Genetic Variation
PLoS pathogens, 2016, Vol.12 (5), p.e1005646
Delviks-Frankenberry, Krista A;Nikolaitchik, Olga A;Burdick, Ryan C;Gorelick, Robert J;Keele, Brandon F;Hu, Wei-Shau;Pathak, Vinay K;Ross, Susan R
2016
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Transient viral replication during analytical treatment interruptions in SIV infected macaques can alter the rebound-competent viral reservoir
PLoS pathogens, 2021, Vol.17 (6), p.e1009686-e1009686
Immonen, Taina T;Fennessey, Christine M;Lipkey, Leslie;Thorpe, Abigail;Del Prete, Gregory Q;Lifson, Jeffrey D;Davenport, Miles P;Keele, Brandon F;O’Doherty, Una
2021
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The mucosal barrier and anti-viral immune responses can eliminate portions of the viral population during transmission and early viral growth
PloS one, 2021, Vol.16 (12), p.e0260010-e0260010
Moriarty, Ryan V;Golfinos, Athena E;Gellerup, Dane D;Schweigert, Hannah;Mathiaparanam, Jaffna;Balgeman, Alexis J;Weiler, Andrea M;Friedrich, Thomas C;Keele, Brandon F;Davenport, Miles P;Venturi, Vanessa;O'Connor, Shelby L;Apetrei, Cristian
2021
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HIV-1 viremia not suppressible by antiretroviral therapy can originate from large T cell clones producing infectious virus
The Journal of clinical investigation, 2020, Vol.130 (11), p.5847-5857
Halvas, Elias K;Joseph, Kevin W;Brandt, Leah D;Guo, Shuang;Sobolewski, Michele D;Jacobs, Jana L;Tumiotto, Camille;Bui, John K;Cyktor, Joshua C;Keele, Brandon F;Morse, Gene D;Bale, Michael J;Shao, Wei;Kearney, Mary F;Coffin, John M;Rausch, Jason W;Wu, Xiaolin;Hughes, Stephen H;Mellors, John W
2020
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HIV-1–induced AIDS in monkeys
Science (American Association for the Advancement of Science), 2014, Vol.344 (6190), p.1401-1405
Hatziioannou, Theodora;Del Prete, Gregory Q;Keele, Brandon F;Estes, Jacob D;McNatt, Matthew W;Bitzegeio, Julia;Raymond, Alice;Rodriguez, Anthony;Schmidt, Fabian;Mac Trubey, C;Smedley, Jeremy;Piatak, Jr, Michael;KewalRamani, Vineet N;Lifson, Jeffrey D;Bieniasz, Paul D
2014
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Genetically barcoded SIV reveals the emergence of escape mutations in multiple viral lineages during immune escape
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2020, Vol.117 (1), p.494-502
Immonen, Taina T;Camus, Celine;Reid, Carolyn;Fennessey, Christine M;Del Prete, Gregory Q;Davenport, Miles P;Lifson, Jeffrey D;Keele, Brandon F
2020
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Site-Specific Glycosylation of Virion-Derived HIV-1 Env Is Mimicked by a Soluble Trimeric Immunogen
Cell reports (Cambridge), 2018, Vol.24 (8), p.1958-1966.e5
Struwe, Weston B.;Chertova, Elena;Allen, Joel D.;Seabright, Gemma E.;Watanabe, Yasunori;Harvey, David J.;Medina-Ramirez, Max;Roser, James D.;Smith, Rodman;Westcott, David;Keele, Brandon F.;Bess, Julian W.;Sanders, Rogier W.;Lifson, Jeffrey D.;Moore, John P.;Crispin, Max
2018
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Hypercytotoxicity and rapid loss of NKp44+ innate lymphoid cells during acute SIV infection
PLoS pathogens, 2014, Vol.10 (12), p.e1004551
Li, Haiying;Richert-Spuhler, Laura E;Evans, Tristan I;Gillis, Jacqueline;Connole, Michelle;Estes, Jacob D;Keele, Brandon F;Klatt, Nichole R;Reeves, R Keith;Silvestri, Guido
2014
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HIV evolution in early infection: selection pressures, patterns of insertion and deletion, and the impact of APOBEC
PLoS pathogens, 2009, Vol.5 (5), p.e1000414-e1000414
Wood, Natasha;Bhattacharya, Tanmoy;Keele, Brandon F;Giorgi, Elena;Liu, Michael;Gaschen, Brian;Daniels, Marcus;Ferrari, Guido;Haynes, Barton F;McMichael, Andrew;Shaw, George M;Hahn, Beatrice H;Korber, Bette;Seoighe, Cathal;Douek, Danny C.
2009
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Replicating Adenovirus-Simian Immunodeficiency Virus (SIV) Recombinant Priming and Envelope Protein Boosting Elicits Localized, Mucosal IgA Immunity in Rhesus Macaques Correlated with Delayed Acquisition following a Repeated Low-Dose Rectal SIVmac251 Challenge
Journal of Virology, 2012, Vol.86 (8), p.4644-4657
PENG XIAO;JEAN PATTERSON, L;KALISZ, Irene;KALYANARAMAN, Vaniambadi S;PAL, Ranajit;MONTEFIORI, David;KEELE, Brandon F;ROBERT-GUROFF, Marjorie;KUATE, Seraphin;BROCCA-COFANO, Egidio;THOMAS, Michael A;VENZON, David;JUN ZHAO;DIPASQUALE, Janet;FENIZIA, Claudio;MI LEE, Eun
2012
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Origin of rebound virus in chronically SIV-infected Rhesus monkeys following treatment discontinuation
Nature communications, 2020, Vol.11 (1), p.5412-5412
Liu, Po-Ting;Keele, Brandon F.;Abbink, Peter;Mercado, Noe B.;Liu, Jinyan;Bondzie, Esther A.;Chandrashekar, Abishek;Borducchi, Erica N.;Hesselgesser, Joseph;Mish, Michael;Chin, Gregory;Bekerman, Elena;Geleziunas, Romas;Barouch, Dan H.
2020
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Barriers to mucosal transmission of immunodeficiency viruses
Blood, 2011, Vol.118 (4), p.839-846
Keele, Brandon F.;Estes, Jacob D.
2011
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Low-Dose Mucosal Simian Immunodeficiency Virus Infection Restricts Early Replication Kinetics and Transmitted Virus Variants in Rhesus Monkeys
Journal of Virology, 2010, Vol.84 (19), p.10406-10412
JINYAN LIU;KEELE, Brandon F;LETVIN, Norman L;HAHN, Beatrice H;SHAW, George M;BAROUCH, Dan H;HUI LI;KEATING, Sheila;NORRIS, Philip J;CARVILLE, Angela;MANSFIELD, Keith G;TOMARAS, Georgia D;HAYNES, Barton F;KOLODKIN-GAL, Dror
2010
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Virus-driven Inflammation Is Associated With the Development of bNAbs in Spontaneous Controllers of HIV
Clinical infectious diseases, 2017, Vol.64 (8), p.1098-1104
Dugast, Anne-Sophie;Arnold, Kelly;Lofano, Giuseppe;Moore, Sarah;Hoffner, Michelle;Simek, Melissa;Poignard, Pascal;Seaman, Michael;Suscovich, Todd J;Pereyra, Florencia;Walker, Bruce D;Lauffenburger, Doug;Kwon, Douglas S;Keele, Brandon F;Alter, Galit
2017
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A spatio-temporal assessment of simian/human immunodeficiency virus (SHIV) evolution reveals a highly dynamic process within the host
PLoS pathogens, 2017, Vol.13 (5), p.e1006358-e1006358
Feder, Alison F;Kline, Christopher;Polacino, Patricia;Cottrell, Mackenzie;Kashuba, Angela D M;Keele, Brandon F;Hu, Shiu-Lok;Petrov, Dmitri A;Pennings, Pleuni S;Ambrose, Zandrea;Silvestri, Guido
2017
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