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Environments that induce synthetic microbial ecosystems
PLoS computational biology, 2010-11, Vol.6 (11), p.e1001002-e1001002
2010
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Detailed simulations of cell biology with Smoldyn 2.1
PLoS computational biology, 2010-03, Vol.6 (3), p.e1000705-e1000705
2010
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Global entrainment of transcriptional systems to periodic inputs
PLoS computational biology, 2010-04, Vol.6 (4), p.e1000739-e1000739
2010
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Linking human diseases to animal models using ontology-based phenotype annotation
PLoS biology, 2009-11, Vol.7 (11), p.e1000247-e1000247
2009
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A new integrated variable based on thermometry, actimetry and body position (TAP) to evaluate circadian system status in humans
PLoS computational biology, 2010-11, Vol.6 (11), p.e1000996-e1000996
2010
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Optimal experimental design for parameter estimation of a cell signaling model
PLoS computational biology, 2009-11, Vol.5 (11), p.e1000558-e1000558
2009
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Automatic design of digital synthetic gene circuits
PLoS computational biology, 2011-02, Vol.7 (2), p.e1001083-e1001083
2011
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Optimal signal processing in small stochastic biochemical networks
PloS one, 2007-10, Vol.2 (10), p.e1077-e1077
2007
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'Glocal' robustness analysis and model discrimination for circadian oscillators
PLoS computational biology, 2009-10, Vol.5 (10), p.e1000534-e1000534
2009
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Scalable rule-based modelling of allosteric proteins and biochemical networks
PLoS computational biology, 2010-11, Vol.6 (11), p.e1000975-e1000975
2010
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Metabolomics to unveil and understand phenotypic diversity between pathogen populations
PLoS neglected tropical diseases, 2010-11, Vol.4 (11), p.e904-e904
2010
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Predicting positive p53 cancer rescue regions using Most Informative Positive (MIP) active learning
PLoS computational biology, 2009-09, Vol.5 (9), p.e1000498
2009
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Extended kalman filter for estimation of parameters in nonlinear state-space models of biochemical networks
PloS one, 2008-11, Vol.3 (11), p.e3758-e3758
2008
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Molecular predictors of 3D morphogenesis by breast cancer cell lines in 3D culture
PLoS computational biology, 2010-02, Vol.6 (2), p.e1000684-e1000684
2010
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Sensing and integration of Erk and PI3K signals by Myc
PLoS computational biology, 2008-02, Vol.4 (2), p.e1000013-e1000013
2008
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Effects of transcriptional pausing on gene expression dynamics
PLoS computational biology, 2010-03, Vol.6 (3), p.e1000704-e1000704
2010
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An environment-sensitive synthetic microbial ecosystem
PloS one, 2010-05, Vol.5 (5), p.e10619-e10619
2010
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The origins of time-delay in template biopolymerization processes
PLoS computational biology, 2010-04, Vol.6 (4), p.e1000726-e1000726
2010
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Simulating microdosimetry in a virtual hepatic lobule
PLoS computational biology, 2010-04, Vol.6 (4), p.e1000756
2010
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Modulation of alpha-synuclein aggregation by dopamine analogs
PloS one, 2010-02, Vol.5 (2), p.e9234-e9234
2010
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Female dominance over males in primates: self-organisation and sexual dimorphism
PloS one, 2008-07, Vol.3 (7), p.e2678-e2678
2008
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Non-linear neuronal responses as an emergent property of afferent networks: a case study of the locust lobula giant movement detector
PLoS computational biology, 2010-03, Vol.6 (3), p.e1000701-e1000701
2010
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Targeted development of registries of biological parts
PloS one, 2008-07, Vol.3 (7), p.e2671-e2671
2008
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Timing cellular decision making under noise via cell-cell communication
PloS one, 2009-03, Vol.4 (3), p.e4872-e4872
2009
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Efficient estimation of the robustness region of biological models with oscillatory behavior
PloS one, 2010-04, Vol.5 (4), p.e9865-e9865
2010
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