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SCODE: an efficient regulatory network inference algorithm from single-cell RNA-Seq during differentiation

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-08, Vol.33 (15), p.2314-2321

2017

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LEAP: constructing gene co-expression networks for single-cell RNA-sequencing data using pseudotime ordering

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-03, Vol.33 (5), p.764-766

2017

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RankProd 2.0: a refactored bioconductor package for detecting differentially expressed features in molecular profiling datasets

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-09, Vol.33 (17), p.2774-2775

2017

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Entropy-based consensus clustering for patient stratification

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-09, Vol.33 (17), p.2691-2698

2017

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Meta-analytic principal component analysis in integrative omics application

Bioinformatics, 2018-04, Vol.34 (8), p.1321-1328

2018

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QUBIC: a bioconductor package for qualitative biclustering analysis of gene co-expression data

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-02, Vol.33 (3), p.450-452

2017

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Towards unified quality verification of synthetic count data with countsimQC

Bioinformatics, 2018-02, Vol.34 (4), p.691-692

2018

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Extreme IR: Extraordinary Cases in Interventional Radiology and Endovascular Therapies

Haskal, Ziv J

1, 2023

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Fast bootstrapping-based estimation of confidence intervals of expression levels and differential expression from RNA-Seq data

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-10, Vol.33 (20), p.3302-3304

2017

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myTAI: evolutionary transcriptomics with R

Bioinformatics, 2018-05, Vol.34 (9), p.1589-1590

2018

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Radiolabelled apoptotic probe may be a vehicle for a novel multimodality radionuclide tumour therapy

European journal of nuclear medicine and molecular imaging, 2014-06, Vol.41 (6), p.1255-1256

2014

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The Psychology of Closed Self-Paced Motor Tasks in Sports

1, 2022

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TSIS: an R package to infer alternative splicing isoform switches for time-series data

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-10, Vol.33 (20), p.3308-3310

2017

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ImpulseDE: detection of differentially expressed genes in time series data using impulse models

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-03, Vol.33 (5), p.757-759

2017

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Reference point insensitive molecular data analysis

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-01, Vol.33 (2), p.219-226

2017

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rMATS-DVR: rMATS discovery of differential variants in RNA

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-07, Vol.33 (14), p.2216-2217

2017

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The Suez Canal: Past Lessons and Future Challenges

2023

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Condition-adaptive fused graphical lasso (CFGL): An adaptive procedure for inferring condition-specific gene co-expression network

PLoS computational biology, 2018-09, Vol.14 (9), p.e1006436-e1006436

2018

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Powerful differential expression analysis incorporating network topology for next-generation sequencing data

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-05, Vol.33 (10), p.1505-1513

2017

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Safety of 5914 intravitreal ziv-aflibercept injections

British journal of ophthalmology, 2019-06, Vol.103 (6), p.805

2019

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switchde: inference of switch-like differential expression along single-cell trajectories

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-04, Vol.33 (8), p.1241-1242

2017

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Sparse redundancy analysis of high-dimensional genetic and genomic data

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-10, Vol.33 (20), p.3228-3234

2017

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FUNNEL-GSEA: FUNctioNal ELastic-net regression in time-course gene set enrichment analysis

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-07, Vol.33 (13), p.1944-1952

2017

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iSmaRT: a toolkit for a comprehensive analysis of small RNA-Seq data

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-03, Vol.33 (6), p.938-940

2017

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Detecting hidden batch factors through data-adaptive adjustment for biological effects

Bioinformatics, 2018-04, Vol.34 (7), p.1141-1147

2018

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