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Toward the novel AI tasks in infection biology
mSphere, 2024-02, Vol.9 (2), p.e0059123-e0059123
2024
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Defining host-pathogen interactions employing an artificial intelligence workflow
eLife, 2019-02, Vol.8
2019
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mSphere of Influence: the Rise of Artificial Intelligence in Infection Biology
mSphere, 2019-06, Vol.4 (3)
2019
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A weak-labelling and deep learning approach for in-focus object segmentation in 3D widefield microscopy
Scientific reports, 2023-07, Vol.13 (1), p.12275-12275, Article 12275
2023
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A deep learning dataset for sample preparation artefacts detection in multispectral high-content microscopy
Scientific data, 2024-02, Vol.11 (1), p.232-232, Article 232
2024
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The nuclear export factor CRM1 controls juxta-nuclear microtubule-dependent virus transport
Journal of cell science, 2017-07, Vol.130 (13), p.2185-2195
2017
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Imaging, Tracking and Computational Analyses of Virus Entry and Egress with the Cytoskeleton
Viruses, 2018-03, Vol.10 (4), p.166
2018
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Labels in a haystack: Approaches beyond supervised learning in biomedical applications
Patterns (New York, N.Y.), 2021-12, Vol.2 (12), p.100383-100383, Article 100383
2021
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Inhibition of Poxvirus Gene Expression and Genome Replication by Bisbenzimide Derivatives
Journal of virology, 2017-09, Vol.91 (18)
2017
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Open-Source Biomedical Image Analysis Models: A Meta-Analysis and Continuous Survey
Frontiers in bioinformatics, 2022-07, Vol.2, p.912809-912809
2022
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Figure Correction: Using Social Media to Help Understand Patient-Reported Health Outcomes of Post-COVID-19 Condition: Natural Language Processing Approach
Journal of medical Internet research, 2023-12, Vol.25 (1), p.e55010-e55010
2023
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Plaque2.0-A High-Throughput Analysis Framework to Score Virus-Cell Transmission and Clonal Cell Expansion
PloS one, 2015-09, Vol.10 (9), p.e0138760-e0138760
2015
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A clinical microscopy dataset to develop a deep learning diagnostic test for urinary tract infection
Scientific data, 2024-02, Vol.11 (1), p.155-155, Article 155
2024
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Editorial: Machine Learning Methodologies to Study Molecular Interactions
Frontiers in molecular biosciences, 2021-12, Vol.8, p.806474-806474
2021
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The zebrafish as a novel model for the in vivo study of Toxoplasma gondii replication and interaction with macrophages
Disease models & mechanisms, 2020-07, Vol.13 (7)
2020
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Bisbenzimide compounds inhibit the replication of prototype and pandemic potential poxviruses
Microbiology spectrum, 2024-04, Vol.12 (4), p.e0407223-e0407223
2024
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Cell-Free Transmission of Human Adenovirus by Passive Mass Transfer in Cell Culture Simulated in a Computer Model
Journal of Virology, 2012-09, Vol.86 (18), p.10123-10137
2012
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Microscopy deep learning predicts virus infections and reveals mechanics of lytic-infected cells
iScience, 2021-06, Vol.24 (6), p.102543-102543, Article 102543
2021
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Mimicry Embedding Facilitates Advanced Neural Network Training for Image-Based Pathogen Detection
mSphere, 2020-09, Vol.5 (5)
2020
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A high-content image-based drug screen of clinical compounds against cell transmission of adenovirus
Scientific data, 2020-08, Vol.7 (1), p.265-265, Article 265
2020
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High-content, arrayed compound screens with rhinovirus, influenza A virus and herpes simplex virus infections
Scientific data, 2022-10, Vol.9 (1), p.610-610, Article 610
2022
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Label-Free Digital Holo-tomographic Microscopy Reveals Virus-Induced Cytopathic Effects in Live Cells
mSphere, 2018-11, Vol.3 (6)
2018
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A tandem segmentation-classification approach for the localization of morphological predictors of C. elegans lifespan and motility
Aging (Albany, NY.), 2022-02, Vol.14 (4), p.1665-1677
2022
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Sequencing meets machine learning to fight emerging pathogens: A preview
Patterns (New York, N.Y.), 2022-02, Vol.3 (2), p.100448-100448, Article 100448
2022
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Infectio: a Generic Framework for Computational Simulation of Virus Transmission between Cells
mSphere, 2016-01, Vol.1 (1)
2016
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