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Using Supervised Learning Methods for Gene Selection in RNA-Seq Case-Control Studies
Frontiers in genetics, 2018-08, Vol.9, p.297-297
2018
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Molecular profiling of a real-world breast cancer cohort with genetically inferred ancestries reveals actionable tumor biology differences between European ancestry and African ancestry patient populations
Breast cancer research : BCR, 2023-05, Vol.25 (1), p.58-58, Article 58
2023
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Transcriptome-wide analysis of natural antisense transcripts shows their potential role in breast cancer
Scientific reports, 2017-12, Vol.7 (1), p.17452-12, Article 17452
2017
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Circulating microRNA-based screening tool for breast cancer
Oncotarget, 2016-02, Vol.7 (5), p.5416-5428
2016
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Rapid response to the alpha-1 adrenergic agent phenylephrine in the perioperative period is impacted by genomics and ancestry
The pharmacogenomics journal, 2021-04, Vol.21 (2), p.174-189
2021
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Evaluation of BRCA1-related molecular features and microRNAs as prognostic factors for triple negative breast cancers
BMC cancer, 2015-10, Vol.15 (1), p.755-755, Article 755
2015
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VPS51 biallelic variants cause microcephaly with brain malformations: A confirmatory report
European journal of medical genetics, 2019-08, Vol.62 (8), p.103704-103704, Article 103704
2019
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Variations of circulating cardiac biomarkers during and after anthracycline-containing chemotherapy in breast cancer patients
BMC cancer, 2018-01, Vol.18 (1), p.102-9, Article 102
2018
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Genomic studies of multiple myeloma reveal an association between X chromosome alterations and genomic profile complexity
Genes chromosomes & cancer, 2017-01, Vol.56 (1), p.18-27
2017
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Exome copy number variation detection: Use of a pool of unrelated healthy tissue as reference sample
Genetic epidemiology, 2017-01, Vol.41 (1), p.35-40
2017
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Abstract 242: Transferring diagnostic and prognostic molecular models across technological platforms
Cancer research (Chicago, Ill.), 2021-07, Vol.81 (13_Supplement), p.242-242
2021
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Towards cancer mega-cohorts: A novel homogenization algorithm applied to diverse breast cancer RNA-Seq datasets
Journal of clinical oncology, 2020-05, Vol.38 (15_suppl), p.e13507-e13507
2020
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EPS: automated feature selection in case–control studies using extreme pseudo-sampling
Bioinformatics (Oxford, England), 2021-10, Vol.37 (19), p.3372-3373
2021
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Toward a fine-scale population health monitoring system
Cell, 2021-04, Vol.184 (8), p.2068-2083.e11
2021
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Privacy preserving validation for multiomic prediction models
Briefings in bioinformatics, 2022-05, Vol.23 (3)
2022
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Abstract A002: Purity Independent Subtyping of Tumor (PurIST): Real-world data validation of a pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) gene expression classifier and its prognostic implications
Cancer research (Chicago, Ill.), 2022-11, Vol.82 (22_Supplement), p.A002-A002
2022
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Abstract 766: Genomic and transcriptomic comparison between breast cancers from patients of African and European genetically determined ancestries demonstrates potential for ancestry specific biomarker-informed therapies
Cancer research (Chicago, Ill.), 2022-06, Vol.82 (12_Supplement), p.766-766
2022
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Genetic study of triple negative breast cancers
Annals of oncology, 2015-05, Vol.26, p.iii10-iii10
2015
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