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ATSE: a peptide toxicity predictor by exploiting structural and evolutionary information based on graph neural network and attention mechanism
Briefings in bioinformatics, 2021-09, Vol.22 (5)
2021
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GSAML-DTA: An interpretable drug-target binding affinity prediction model based on graph neural networks with self-attention mechanism and mutual information
Computers in biology and medicine, 2022-11, Vol.150, p.106145-106145, Article 106145
2022
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iDNA-MT: Identification DNA Modification Sites in Multiple Species by Using Multi-Task Learning Based a Neural Network Tool
Frontiers in genetics, 2021-03, Vol.12, p.663572-663572
2021
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ToxIBTL: prediction of peptide toxicity based on information bottleneck and transfer learning
Bioinformatics, 2022-03, Vol.38 (6), p.1514-1524
2022
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MDL-CPI: Multi-view deep learning model for compound-protein interaction prediction
Methods (San Diego, Calif.), 2022-08, Vol.204, p.418-427
2022
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MultiscaleDTA: A multiscale-based method with a self-attention mechanism for drug-target binding affinity prediction
Methods (San Diego, Calif.), 2022-11, Vol.207, p.103-109
2022
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AFP-MFL: accurate identification of antifungal peptides using multi-view feature learning
Briefings in bioinformatics, 2023-01, Vol.24 (1)
2023
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HELM-GPT: de novo macrocyclic peptide design using generative pre-trained transformer
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-06, Vol.40 (6)
2024
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Better Performance with Transformer: CPPFormer in the Precise Prediction of Cell-penetrating Peptides
Current medicinal chemistry, 2022-02, Vol.29 (5), p.881-893
2022
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PSSP-MVIRT: peptide secondary structure prediction based on a multi-view deep learning architecture
Briefings in bioinformatics, 2021-11, Vol.22 (6)
2021
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SiameseCPP: a sequence-based Siamese network to predict cell-penetrating peptides by contrastive learning
Briefings in bioinformatics, 2023-01, Vol.24 (1)
2023
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ToxinMI: improving peptide toxicity prediction by fusing multimodal information based on mutual information
Proceedings of the Conference on Research in Adaptive and Convergent Systems, 2022, p.77-82
2022
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A Comparative Study on Evolutionary Multi-objective Optimization Algorithms Estimating Surface Duct
Sensors (Basel, Switzerland), 2018-12, Vol.18 (12), p.4428
2018
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面向地理分析模拟的城市小区场景数据组织方法
测绘学报, 2018-08, Vol.47 (8), p.1080-1088
2018
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