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  • BibTeX
igv.js: an embeddable JavaScript implementation of the Integrative Genomics Viewer (IGV)
Bioinformatics (Oxford, England), 2023-01, Vol.39 (1)
2023
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Variant Review with the Integrative Genomics Viewer
Cancer research (Chicago, Ill.), 2017-11, Vol.77 (21), p.e31-e34
2017
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Integrative Genomics Viewer (IGV): high-performance genomics data visualization and exploration
Briefings in bioinformatics, 2013-03, Vol.14 (2), p.178-192
2013
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Molecular signatures database (MSigDB) 3.0
Bioinformatics (Oxford, England), 2011-06, Vol.27 (12), p.1739-1740
2011
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Integrative genomic analysis by interoperation of bioinformatics tools in GenomeSpace
Nature methods, 2016-03, Vol.13 (3), p.245-247
2016
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Integrative genomics viewer
Nature biotechnology, 2011-01, Vol.29 (1), p.24-26
2011
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The Molecular Signatures Database Hallmark Gene Set Collection
Cell systems, 2015-12, Vol.1 (6), p.417-425
2015
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Extending support for mouse data in the Molecular Signatures Database (MSigDB)
Nature methods, 2023-11, Vol.20 (11), p.1619-1620
2023
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Juicebox.js Provides a Cloud-Based Visualization System for Hi-C Data
Cell systems, 2018-02, Vol.6 (2), p.256-258.e1
2018
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Quantitative visualization of alternative exon expression from RNA-seq data
Bioinformatics, 2015-07, Vol.31 (14), p.2400-2402
2015
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Genome-wide analysis and visualization of copy number with CNVpytor in igv.js
Bioinformatics (Oxford, England), 2024-08, Vol.40 (8)
2024
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The GenePattern Notebook Environment
Cell systems, 2017-08, Vol.5 (2), p.149-151.e1
2017
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Abstract 5106: The GenePattern Notebook environment for reproducible cancer research
Cancer research (Chicago, Ill.), 2019-07, Vol.79 (13_Supplement), p.5106-5106
2019
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Abstract 3207: GenePattern Notebook: An integrative analytical environment for cancer research
Cancer research (Chicago, Ill.), 2020-08, Vol.80 (16_Supplement), p.3207-3207
2020
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A genomic data viewer for iPad
Genome Biology, 2015-02, Vol.16 (1), p.46-46, Article 46
2015
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Abstract 2279: The GenePattern Notebook environment for reproducible cancer research
Cancer research (Chicago, Ill.), 2018-07, Vol.78 (13_Supplement), p.2279-2279
2018
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Abstract 2588: GenePattern Notebook: an environment for reproducible cancer research
Cancer research (Chicago, Ill.), 2017-07, Vol.77 (13_Supplement), p.2588-2588
2017
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Abstract 3968: Exploring cancer datasets in the integrative genomics viewer (IGV)
Cancer research (Chicago, Ill.), 2012-04, Vol.72 (8_Supplement), p.3968-3968
2012
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Abstract 6568: Extended support for model organisms: The next frontier for the molecular signatures database
Cancer research (Chicago, Ill.), 2023-04, Vol.83 (7_Supplement), p.6568-6568
2023
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Abstract 2073: Genomics to Notebook (g2nb): Extending the electronic notebook to address the needs of cancer bioinformatics
Cancer research (Chicago, Ill.), 2023-04, Vol.83 (7_Supplement), p.2073-2073
2023
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Abstract 5273: GenePattern Notebooks: an integrative analytical environment for cancer research
Cancer research (Chicago, Ill.), 2016-07, Vol.76 (14_Supplement), p.5273-5273
2016
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Abstract 5331: GenomeSpace: An environment for frictionless bioinformatics
Cancer research (Chicago, Ill.), 2014-10, Vol.74 (19_Supplement), p.5331-5331
2014
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A multi-tool recipe to identify regions of protein-DNA binding and their influence on associated gene expression [version 2; peer review: 2 approved]
F1000 research, 2017-01, Vol.6, p.784-784
2017
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Abstract 5141: GenomeSpace: an environment for frictionless bioinformatics
Cancer research (Chicago, Ill.), 2013-04, Vol.73 (8_Supplement), p.5141-5141
2013
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Abstract 3966: GenomeSpace: An environment for frictionless bioinformatics
Cancer research (Chicago, Ill.), 2012-04, Vol.72 (8_Supplement), p.3966-3966
2012
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