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Preparation of E. coli RNA polymerase transcription elongation complexes by selective photoelution from magnetic beads
The Journal of biological chemistry, 2021-07, Vol.297 (1), p.100812-100812, Article 100812
2021
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Isolation of E. coli RNA polymerase transcription elongation complexes by selective solid-phase photoreversible immobilization
Methods in enzymology, 2023, Vol.691, p.223-250
2023
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Efficient Linear dsDNA Tagging Using Deoxyuridine Excision
Chembiochem : a European journal of chemical biology, 2021-11, Vol.22 (22), p.3214-3224
2021
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Observation of coordinated RNA folding events by systematic cotranscriptional RNA structure probing
Nature communications, 2023-11, Vol.14 (1), p.7839-7839, Article 7839
2023
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Cotranscriptional folding of a riboswitch at nucleotide resolution
Nature structural & molecular biology, 2016-12, Vol.23 (12), p.1124
2016
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A ligand-gated strand displacement mechanism for ZTP riboswitch transcription control
Nature chemical biology, 2019-11, Vol.15 (11), p.1067
2019
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Preparation and Characterization of Internally Modified DNA Templates for Chemical Transcription Roadblocking
Bio-protocol, 2021-09, Vol.11 (17), p.e4141-e4141
2021
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Purification of synchronized Escherichia coli transcription elongation complexes by reversible immobilization on magnetic beads
The Journal of biological chemistry, 2022-04, Vol.298 (4), p.101789-101789, Article 101789
2022
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Chemical roadblocking of DNA transcription for nascent RNA display
The Journal of biological chemistry, 2020-05, Vol.295 (19), p.6401-6412
2020
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RNA systems biology: uniting functional discoveries and structural tools to understand global roles of RNAs
Current opinion in biotechnology, 2016-06, Vol.39, p.182-191
2016
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Distributed biotin-streptavidin transcription roadblocks for mapping cotranscriptional RNA folding
Nucleic acids research, 2017-07, Vol.45 (12), p.e109
2017
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Discovery of LX2761, a Sodium-Dependent Glucose Cotransporter 1 (SGLT1) Inhibitor Restricted to the Intestinal Lumen, for the Treatment of Diabetes
Journal of medicinal chemistry, 2017-01, Vol.60 (2), p.710-721
2017
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Characterizing RNA structures in vitro and in vivo with selective 2′-hydroxyl acylation analyzed by primer extension sequencing (SHAPE-Seq)
Methods (San Diego, Calif.), 2016-07, Vol.103, p.34-48
2016
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Tuning isoform selectivity and bortezomib sensitivity with a new class of alkenyl indene PDI inhibitor
European journal of medicinal chemistry, 2020-01, Vol.186, p.111906-111906, Article 111906
2020
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Regulation of promoter-proximal transcription elongation: enhanced DNA scrunching drives λQ antiterminator-dependent escape from a σ70-dependent pause
Nucleic acids research, 2014-04, Vol.42 (8), p.5097
2014
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Potency of a small molecule that targets the molluscum contagiosum virus processivity factor increases when conjugated to a tripeptide
Antiviral research, 2024-06, Vol.226, p.105899-105899, Article 105899
2024
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A universal transcription pause sequence is an element of initiation factor σ70-dependent pausing
Nucleic acids research, 2016-08, Vol.44 (14), p.6732
2016
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A small molecule that targets the processivity factor of molluscum contagiosum virus has therapeutic potential
Antiviral research, 2023-03, Vol.211, p.105520-105520, Article 105520
2023
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Two transcription pause elements underlie a σ70-dependent pause cycle
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2015-08, Vol.112 (32), p.E4374-E4380
2015
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SnapShot: RNA Structure Probing Technologies
Cell, 2018-10, Vol.175 (2), p.600-600.e1
2018
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LX2761, a Sodium/Glucose Cotransporter 1 Inhibitor Restricted to the Intestine, Improves Glycemic Control in Mice
The Journal of pharmacology and experimental therapeutics, 2017-07, Vol.362 (1), p.85
2017
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Mutation and structure guided discovery of an antiviral small molecule that mimics an essential C-Terminal tripeptide of the vaccinia D4 processivity factor
Antiviral research, 2019-02, Vol.162, p.178-185
2019
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Discovery of a Type III Inhibitor of LIM Kinase 2 That Binds in a DFG-Out Conformation
ACS medicinal chemistry letters, 2015-01, Vol.6 (1), p.53-57
2015
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Isolation of synchronized E. coli elongation complexes for solid-phase and solution-based in vitro transcription assays
Methods in enzymology, 2022, Vol.675, p.159-192
2022
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Macrocyclic BACE inhibitors: Optimization of a micromolar hit to nanomolar leads
Bioorganic & medicinal chemistry letters, 2010-05, Vol.20 (10), p.3158-3160
2010
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