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ModBase, a database of annotated comparative protein structure models and associated resources
Nucleic acids research, 2014-01, Vol.42 (Database issue), p.D336
2014
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Restraint-based three-dimensional modeling of genomes and genomic domains
FEBS letters, 2015-10, Vol.589 (20), p.2987-2995
2015
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SAS profile correlations reveal SAS hierarchical nature and information content
PloS one, 2017-05, Vol.12 (5), p.e0177309-e0177309
2017
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Binless normalization of Hi-C data provides significant interaction and difference detection independent of resolution
Nature communications, 2019-04, Vol.10 (1), p.1938-1938, Article 1938
2019
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Pan-cancer predictions of transcription factors mediating aberrant DNA methylation
Epigenetics & chromatin, 2022-03, Vol.15 (1), p.10-10, Article 10
2022
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A convective replica-exchange method for sampling new energy basins
Journal of computational chemistry, 2013-01, Vol.34 (2), p.132-140
2013
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Automatic Bayesian Weighting for SAXS Data
Frontiers in molecular biosciences, 2021-06, Vol.8, p.671011-671011
2021
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Impact of Thermostats on Folding and Aggregation Properties of Peptides Using the Optimized Potential for Efficient Structure Prediction Coarse-Grained Model
Journal of chemical theory and computation, 2011-05, Vol.7 (5), p.1502-1510
2011
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On the demultiplexing of chromosome capture conformation data
FEBS letters, 2015-10, Vol.589 (20), p.3005-3013
2015
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Convective Replica-Exchange in Ergodic Regimes
Journal of chemical theory and computation, 2014-03, Vol.10 (3), p.953-958
2014
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SAXS Merge: an automated statistical method to merge SAXS profiles using Gaussian processes
Journal of synchrotron radiation, 2014-01, Vol.21 (1), p.203-208
2014
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SAS Profile Correlations Reveal the Hierarchical Nature of SAS Data and Suggest New Scoring Strategies
Biophysical journal, 2015-01, Vol.108 (2), p.45a-45a
2015
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Erratum: A convective replica-exchange method for sampling new energy basins
Journal of computational chemistry, 2013-07, Vol.34 (18), p.1609-1609
2013
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Promoter bivalency favors an open chromatin architecture in embryonic stem cells
Nature genetics, 2018-10, Vol.50 (10), p.1452-3
2018
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Guidelines for cell-type heterogeneity quantification based on a comparative analysis of reference-free DNA methylation deconvolution software
BMC bioinformatics, 2020-01, Vol.21 (1), p.16-16, Article 16
2020
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