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The macroscopic limit to synchronization of cellular clocks in single cells of Neurospora crassa
Scientific reports, 2022-04, Vol.12 (1), p.6750-6750, Article 6750
2022
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Data-driven modeling reveals cell behaviors controlling self-organization during Myxococcus xanthus development
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2017-06, Vol.114 (23), p.E4592-E4601
2017
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Cellulose hydrolysis in evolving substrate morphologies III: Time-scale analysis
Biotechnology and bioengineering, 2010-10, Vol.107 (2), p.224-234
2010
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Cellulose hydrolysis in evolving substrate morphologies I: A general modeling formalism
Biotechnology and bioengineering, 2009-10, Vol.104 (2), p.261-274
2009
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Cellulose hydrolysis in evolving substrate morphologies II: Numerical results and analysis
Biotechnology and bioengineering, 2009-10, Vol.104 (2), p.275-289
2009
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genetic network for the clock of Neurospora crassa
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2007-02, Vol.104 (8), p.2809-2814
2007
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Synchronizing stochastic circadian oscillators in single cells of Neurospora crassa
Scientific reports, 2016-10, Vol.6 (1), p.35828-35828, Article 35828
2016
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Time-Resolved NMR: Extracting the Topology of Complex Enzyme Networks
Biophysical journal, 2010-10, Vol.99 (7), p.2318-2326
2010
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Competition between DNA Methylation, Nucleotide Synthesis, and Antioxidation in Cancer versus Normal Tissues
Cancer research (Chicago, Ill.), 2017-08, Vol.77 (15), p.4185-4195
2017
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KINSOLVER: A simulator for computing large ensembles of biochemical and gene regulatory networks
Computers & mathematics with applications (1987), 2009-02, Vol.57 (3), p.420-435
2009
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Discovering Regulators in Post-Transcriptional Control of the Biological Clock of Neurospora~crassa Using Variable Topology Ensemble Methods on GPUs
IEEE access, 2018, Vol.6, p.54582-54594
2018
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Single Cells of Neurospora Crassa Show Circadian Oscillations, Light Entrainment, Temperature Compensation, and Phase Synchronization
IEEE access, 2019, Vol.7, p.49403-49417
2019
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Ensemble Methods for Identifying RNA Operons and Regulons in the Clock Network of Neurospora Crassa
IEEE access, 2022, Vol.10, p.32510-32524
2022
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Solving Large Nonlinear Systems of First-Order Ordinary Differential Equations With Hierarchical Structure Using Multi-GPGPUs and an Adaptive Runge Kutta ODE Solver
IEEE access, 2013, Vol.1, p.770-777
2013
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Solving Nonlinear Systems of First Order Ordinary Differential Equations Using a Galerkin Finite Element Method
IEEE access, 2013, Vol.1, p.408-417
2013
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Genome-wide expression analysis of genetic networks in Neurospora crassa
Bioinformation, 2007-04, Vol.1 (10), p.390-395
2007
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Time-Resolved NMR: Extracting the Topology of Complex Enzyme Networks
Biophysical journal, 2010-10, Vol.99 (7)
2010
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Screened-interaction expansion for the Hubbard model and determination of the quantum Monte Carlo Fermi surface
Physical review. B, Condensed matter, 2001-11, Vol.64 (19), Article 195105
2001
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Discovering Regulators in Post-Transcriptional Control of the Biological Clock of [Formula Omitted] Using Variable Topology Ensemble Methods on GPUs
IEEE access, 2018-01, Vol.6, p.54582
2018
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Cellulose hydrolysis in evolving substrate morphologies I: A general modeling formalism; Cellulose hydrolysis in evolving substrate morphologies I: A general modeling formalism
Biotechnology and bioengineering, 2009-10, Vol.104 (2), p.261-274
2009
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DYNAMICS AND TRANSPORT RELAXATION OF A LARGE ACOUSTIC POLARON IN ONE DIMENSION
1984
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