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Inferring parsimonious migration histories for metastatic cancers
Nature genetics, 2018-05, Vol.50 (5), p.718-726
2018
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Haplotype phasing in single-cell DNA-sequencing data
Bioinformatics, 2018-07, Vol.34 (13), p.i211-i217
2018
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Allele-specific transcriptional effects of subclonal copy number alterations enable genotype-phenotype mapping in cancer cells
Nature communications, 2024-03, Vol.15 (1), p.2482-2482, Article 2482
2024
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Quantifying tumor heterogeneity in whole-genome and whole-exome sequencing data
Bioinformatics (Oxford, England), 2014-12, Vol.30 (24), p.3532-3540
2014
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Tumor phylogeny inference using tree-constrained importance sampling
Bioinformatics (Oxford, England), 2017-07, Vol.33 (14), p.i152-i160
2017
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Single Cell Whole Genome Measurement of Genomic Heterogeneity and Clonal Evolution in Multiple Myeloma
Blood, 2023-11, Vol.142 (Supplement 1), p.4722-4722
2023
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Inferring the Mutational History of a Tumor Using Multi-state Perfect Phylogeny Mixtures
Cell systems, 2016-07, Vol.3 (1), p.43-53
2016
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SCARLET: Single-Cell Tumor Phylogeny Inference with Copy-Number Constrained Mutation Losses
Cell systems, 2020-04, Vol.10 (4), p.323-332.e8
2020
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Abstract 5307: Inferring parsimonious migration histories for metastatic cancers
Cancer research (Chicago, Ill.), 2018-07, Vol.78 (13_Supplement), p.5307-5307
2018
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CALDER: Inferring Phylogenetic Trees from Longitudinal Tumor Samples
Cell systems, 2019-06, Vol.8 (6), p.514-522.e5
2019
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DeCiFering the elusive cancer cell fraction in tumor heterogeneity and evolution
Cell systems, 2021-10, Vol.12 (10), p.1004-1018.e10
2021
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OA-26 Single Cell Whole Genome Measurement of Genomic Heterogeneity and Clonal Evolution in Multiple Myeloma
Clinical lymphoma, myeloma and leukemia, 2024-09, Vol.24, p.S17-S17
2024
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The Clonal Evolution of Metastatic Osteosarcoma as Shaped by Cisplatin Treatment
Molecular cancer research, 2019-04, Vol.17 (4), p.895-906
2019
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Abstract PR012: Evolutionary dynamics of whole-genome doubling in ovarian cancer
Cancer research (Chicago, Ill.), 2024-02, Vol.84 (3_Supplement_2), p.PR012-PR012
2024
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