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The PRoteomics IDEntifications (PRIDE) database and associated tools: status in 2013
Nucleic acids research, 2013-01, Vol.41 (Database issue), p.D1063-D1069
2013
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Dynamic Changes in miRNA Expression during the Generation of Expanded and Activated NK Cells
International journal of molecular sciences, 2023-08, Vol.24 (17), p.13556
2023
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Neuron-specific RNA-sequencing reveals different responses in peripheral neurons after nerve injury
eLife, 2024-05, Vol.12
2024
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PRIDE Inspector: a tool to visualize and validate MS proteomics data
Nature biotechnology, 2012-02, Vol.30 (2), p.135-137
2012
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Biological Implications of a Stroke Therapy Based in Neuroglobin Hyaluronate Nanoparticles. Neuroprotective Role and Molecular Bases
International journal of molecular sciences, 2021-12, Vol.23 (1), p.247
2021
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TraML—A Standard Format for Exchange of Selected Reaction Monitoring Transition Lists
Molecular & cellular proteomics, 2012-04, Vol.11 (4), p.R111.015040, Article R111.015040
2012
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Characterization of the Human Plasma Phosphoproteome Using Linear Ion Trap Mass Spectrometry and Multiple Search Engines
Journal of proteome research, 2010-02, Vol.9 (2), p.876-884
2010
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Neuron-specific RNA-sequencing reveals different responses in peripheral neurons after nerve injury
eLife, 2024-05, Vol.12
2024
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The PRoteomics IDEntification (PRIDE) Converter 2 Framework: An Improved Suite of Tools to Facilitate Data Submission to the PRIDE Database and the ProteomeXchange Consortium
Molecular & cellular proteomics, 2012-12, Vol.11 (12), p.1682-1689
2012
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Phosphorylation Analysis of Primary Human T Lymphocytes Using Sequential IMAC and Titanium Oxide Enrichment
Journal of proteome research, 2008-12, Vol.7 (12), p.5167-5176
2008
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Abstract 2755: Transcriptomic changes experienced by activated and expanded NK cells for their use in the treatment of hematological malignancies
Cancer research (Chicago, Ill.), 2022-06, Vol.82 (12_Supplement), p.2755-2755
2022
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Molecular diagnosis of polycystic ovary syndrome in obese and non-obese women by targeted plasma miRNA profiling
European journal of endocrinology, 2021-11, Vol.185 (5), p.637-652
2021
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A collection of open source applications for mass spectrometry data mining
Proteomics (Weinheim), 2014-10, Vol.14 (20), p.2275-2279
2014
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Minimal Information About Sample Preparation for Phosphoproteomics
Nature precedings, 2009-04
2009
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Systematic Collaborative Reanalysis of Genomic Data Improves Diagnostic Yield in Neurologic Rare Diseases
The Journal of molecular diagnostics : JMD, 2022-05, Vol.24 (5), p.529-542
2022
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Comparative proteomic study of early hypoxic response in the cerebral cortex of rats submitted to two different hypoxic models
Proteomics. Clinical applications, 2017-12, Vol.11 (11-12), p.n/a
2017
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The HUPO proteomics standards initiative- mass spectrometry controlled vocabulary
Database : the journal of biological databases and curation, 2013-03, Vol.2013, p.bat009-bat009
2013
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LymPHOS: Design of a phosphosite database of primary human T cells
Proteomics (Weinheim), 2009-07, Vol.9 (14), p.3741-3751
2009
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Proteomic characterization of nitrated cell targets after hypobaric hypoxia and reoxygenation in rat brain
Journal of proteomics, 2014-09, Vol.109, p.309-321
2014
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PRIDE: quality control in a proteomics data repository
Database : the journal of biological databases and curation, 2012, Vol.2012, p.bas004-bas004
2012
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Critical amino acid residues in proteins: a BioMart integration of Reactome protein annotations with PRIDE mass spectrometry data and COSMIC somatic mutations
Database : the journal of biological databases and curation, 2011-01, Vol.2011, p.bar047-bar047
2011
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