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Bile canaliculi remodeling activates YAP via the actin cytoskeleton during liver regeneration
Molecular systems biology, 2020-02, Vol.16 (2), p.e8985-n/a
2020
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Three-dimensional spatially resolved geometrical and functional models of human liver tissue reveal new aspects of NAFLD progression
Nature medicine, 2019-12, Vol.25 (12), p.1885-1893
2019
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A versatile pipeline for the multi-scale digital reconstruction and quantitative analysis of 3D tissue architecture
eLife, 2015-12, Vol.4
2015
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Resilience of three-dimensional sinusoidal networks in liver tissue
PLoS computational biology, 2020-06, Vol.16 (6), p.e1007965-e1007965
2020
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Quantification of nematic cell polarity in three-dimensional tissues
PLoS computational biology, 2020-12, Vol.16 (12), p.e1008412-e1008412
2020
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Regulation of Nodal signaling propagation by receptor interactions and positive feedback
eLife, 2022-09, Vol.11
2022
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Anisotropic expansion of hepatocyte lumina enforced by apical bulkheads
The Journal of cell biology, 2021-10, Vol.220 (10)
2021
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An endosomal tether undergoes an entropic collapse to bring vesicles together
Nature (London), 2016-09, Vol.537 (7618), p.107-111
2016
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Uncovering developmental time and tempo using deep learning
Nature methods, 2023-12, Vol.20 (12), p.2000-2010
2023
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EmbryoNet: using deep learning to link embryonic phenotypes to signaling pathways
Nature methods, 2023-06, Vol.20 (6), p.815-823
2023
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Apical bulkheads accumulate as adaptive response to impaired bile flow in liver disease
EMBO reports, 2023-09, Vol.24 (9), p.e57181-e57181
2023
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Virtual tissue microstructure reconstruction across species using generative deep learning
PloS one, 2024-07, Vol.19 (7), p.e0306073
2024
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Phenotypic characterization of liver tissue heterogeneity through a next-generation 3D single-cell atlas
Scientific reports, 2024-02, Vol.14 (1), p.2823-2823, Article 2823
2024
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The High Mobility Group A1 (HMGA1) Chromatin Architectural Factor Modulates Nuclear Stiffness in Breast Cancer Cells
International journal of molecular sciences, 2019-06, Vol.20 (11), p.2733
2019
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Liquid-crystal organization of liver tissue
eLife, 2019-06, Vol.8
2019
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P-5 THREE-DIMENSIONAL SINGLE-CELL ATLAS OF LIVER TISSUE ARCHITECTURE
Annals of hepatology, 2023-03, Vol.28, p.100909, Article 100909
2023
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Gastrulation: Nodal signaling controls ordered collective cell migration
Current biology, 2022-12, Vol.32 (24), p.R1354-R1356
2022
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Correction: Quantification of nematic cell polarity in three-dimensional tissues
PLoS computational biology, 2021-08, Vol.17 (8), p.e1009349-e1009349
2021
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Three-dimensional single-cell digital atlas of liver tissue architecture
Journal of hepatology, 2023-06, Vol.78, p.S361
2023
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FRI-384 - Three-dimensional single-cell digital atlas of liver tissue architecture
Journal of hepatology, 2023-06, Vol.78, p.S361-S361
2023
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FRI-390 - Accumulation of apical bulkheads and hepatocyte rosettes as adaptive responses upon impaired bile flow in liver diseases
Journal of hepatology, 2023-06, Vol.78, p.S364-S365
2023
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Accumulation of apical bulkheads and hepatocyte rosettes as adaptive responses upon impaired bile flow in liver diseases
Journal of hepatology, 2023-06, Vol.78, p.S364-S365
2023
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A Predictive 3D Multi-Scale Model of Biliary Fluid Dynamics in the Liver Lobule
Cell systems, 2017-03, Vol.4 (3), p.277-290.e9
2017
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Prediction of Multiple 3D Tissue Structures Based on Single-Marker Images Using Convolutional Neural Networks
2019 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), 2019, p.1361-1365
2019
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Automatic recognition and characterization of different non-parenchymal cells in liver tissue
2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2016, p.536-540
2016
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