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The Microbiome Stress Project: Toward a Global Meta-Analysis of Environmental Stressors and Their Effects on Microbial Communities
Frontiers in microbiology, 2019-01, Vol.9, p.3272
2019
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Tracking defined microbial communities by multicolor flow cytometry reveals tradeoffs between productivity and diversity
Frontiers in microbiology, 2023-01, Vol.13, p.910390-910390
2023
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The importance of accurately correcting for the natural abundance of stable isotopes
Analytical biochemistry, 2017-03, Vol.520, p.27-43
2017
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Antibiotic-induced changes in the microbiota disrupt redox dynamics in the gut
eLife, 2018-06, Vol.7
2018
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AMiGA: Software for Automated Analysis of Microbial Growth Assays
mSystems, 2021-08, Vol.6 (4), p.e0050821
2021
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Human Gut Microbiota Predicts Susceptibility to Vibrio cholerae Infection
The Journal of infectious diseases, 2018-07, Vol.218 (4), p.645-653
2018
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Predicting Vibrio cholerae Infection and Disease Severity Using Metagenomics in a Prospective Cohort Study
The Journal of infectious diseases, 2021-02, Vol.223 (2), p.342-351
2021
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Impact of a human gut microbe on Vibrio cholerae host colonization through biofilm enhancement
eLife, 2022-03, Vol.11
2022
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Systems biology approach to functionally assess the Clostridioides difficile pangenome reveals genetic diversity with discriminatory power
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2022-05, Vol.119 (18), p.e2119396119-e2119396119
2022
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Gut Microbiota From Sjögren syndrome Patients Causes Decreased T Regulatory Cells in the Lymphoid Organs and Desiccation-Induced Corneal Barrier Disruption in Mice
Frontiers in medicine, 2022-03, Vol.9, p.852918-852918
2022
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A comparative study of gut microbiomes in captive nocturnal strepsirrhines
American journal of primatology, 2019-10, Vol.81 (10-11), p.e22986-n/a
2019
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Systems biology analysis of the Clostridioides difficile core-genome contextualizes microenvironmental evolutionary pressures leading to genotypic and phenotypic divergence
NPJ systems biology and applications, 2020-10, Vol.6 (1), p.31-31, Article 31
2020
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AMiGA: Software for Automated Analysis of Microbial Growth Assays
mSystems, 2021-08, Vol.6 (4)
2021
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Predicting Colonization of Microbes in the Human Gut
2018
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Abstract 5239: Unraveling the complex regulatory relationship between PI3K signaling and metabolic transformation in breast cancer
Cancer research (Chicago, Ill.), 2013-04, Vol.73 (8_Supplement), p.5239-5239
2013
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The Gut Microbiome and Susceptibility to Vibrio cholerae Infection
Open forum infectious diseases, 2015-12, Vol.2 (suppl_1)
2015
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697The Gut Microbiome and Susceptibility to Vibrio cholerae Infection
Open forum infectious diseases, 2015-12, Vol.2 (suppl_1), p.S26-S26
2015
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