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Major multilevel molecular divergence between THP‐1 cells from different biorepositories
International journal of cancer, 2020-10, Vol.147 (7), p.2000-2006
2020
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MHC class I-associated peptides derive from selective regions of the human genome
The Journal of clinical investigation, 2016-12, Vol.126 (12), p.4690-4701
2016
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Global proteogenomic analysis of human MHC class I-associated peptides derived from non-canonical reading frames
Nature communications, 2016-01, Vol.7 (1), p.10238-10238, Article 10238
2016
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The expanding roles of Gβγ subunits in G protein-coupled receptor signaling and drug action
Pharmacological reviews, 2013-04, Vol.65 (2), p.545
2013
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BamQuery: a proteogenomic tool to explore the immunopeptidome and prioritize actionable tumor antigens
Genome Biology, 2023-08, Vol.24 (1), p.1-188, Article 188
2023
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Transposable elements regulate thymus development and function
eLife, 2024-04, Vol.12
2024
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Widespread and tissue-specific expression of endogenous retroelements in human somatic tissues
Genome medicine, 2020-04, Vol.12 (1), p.40-40, Article 40
2020
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The MHC I immunopeptidome conveys to the cell surface an integrative view of cellular regulation
Molecular systems biology, 2011-09, Vol.7 (1), p.533-n/a
2011
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A Functional Screen to Identify Novel Effectors of Hematopoietic Stem Cell Activity
Cell, 2009-04, Vol.137 (2), p.369-379
2009
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PSMB11 regulates gene expression in cortical thymic epithelial cells
Cell reports (Cambridge), 2021-09, Vol.36 (10), p.109546-109546, Article 109546
2021
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Detection of Quiescent Radioresistant Epithelial Progenitors in the Adult Thymus
Frontiers in immunology, 2017-12, Vol.8, p.1717-1717
2017
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Two types of human TCR differentially regulate reactivity to self and non-self antigens
iScience, 2022-09, Vol.25 (9), p.104968-104968, Article 104968
2022
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Immunopeptidomic Analyses of Colorectal Cancers With and Without Microsatellite Instability
Molecular & cellular proteomics, 2022-05, Vol.21 (5), p.100228-100228, Article 100228
2022
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Atypical acute myeloid leukemia-specific transcripts generate shared and immunogenic MHC class-I-associated epitopes
Immunity (Cambridge, Mass.), 2021-04, Vol.54 (4), p.737-752.e10
2021
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Breast cancer immunopeptidomes contain numerous shared tumor antigens
The Journal of clinical investigation, 2024-01, Vol.134 (1), p.1-13
2024
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Autophagy degrades immunogenic endogenous retroelements induced by 5-azacytidine in acute myeloid leukemia
Leukemia, 2024-05, Vol.38 (5), p.1019-1031
2024
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Induced pluripotent stem cells display a distinct set of MHC I-associated peptides shared by human cancers
Cell reports (Cambridge), 2022-08, Vol.40 (7), p.111241-111241, Article 111241
2022
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Analysis of blood stem cell activity and cystatin gene expression in a mouse model presenting a chromosomal deletion encompassing Csta and Stfa2l1
PloS one, 2009-10, Vol.4 (10), p.e7500-e7500
2009
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Asymmetric segregation and self-renewal of hematopoietic stem and progenitor cells with endocytic Ap2a2
Blood, 2012-03, Vol.119 (11), p.2510-2522
2012
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Genome-wide interrogation of Mammalian stem cell fate determinants by nested chromosome deletions
PLoS genetics, 2010-12, Vol.6 (12), p.e1001241
2010
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MHC I–associated peptides preferentially derive from transcripts bearing miRNA response elements
Blood, 2012-06, Vol.119 (26), p.e181-e191
2012
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Proteogenomics Uncovers a Vast Repertoire of Shared Tumor-Specific Antigens in Ovarian Cancer
Cancer immunology research, 2020-04, Vol.8 (4), p.544-555
2020
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Transposable elements regulate thymus development and function
eLife, 2024-04, Vol.12
2024
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The tumor-specific antigen landscape of acute myeloid leukemia
Molecular immunology, 2022-10, Vol.150, p.8
2022
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Prediction of Severe Acute Graft-Versus-Host Disease (aGVHD) Based on Whole Transcriptome Sequencing of Donor CD4 T Cells
Blood, 2017-12, Vol.130, p.3249-3249
2017
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