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RNA-QC-chain: comprehensive and fast quality control for RNA-Seq data
BMC genomics, 2018-02, Vol.19 (1), p.144-144, Article 144
2018
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Species-resolved sequencing of low-biomass or degraded microbiomes using 2bRAD-M
Genome Biology, 2022-01, Vol.23 (1), p.36-36, Article 36
2022
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Parallel-META 3: Comprehensive taxonomical and functional analysis platform for efficient comparison of microbial communities
Scientific reports, 2017-01, Vol.7 (1), p.40371-40371, Article 40371
2017
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Meta-Apo improves accuracy of 16S-amplicon-based prediction of microbiome function
BMC genomics, 2021-01, Vol.22 (1), p.9-9, Article 9
2021
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Genome-wide identification of transcription factors and transcription-factor binding sites in oleaginous microalgae Nannochloropsis
Scientific reports, 2014-06, Vol.4 (1), p.5454-5454, Article 5454
2014
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Method development for cross-study microbiome data mining: Challenges and opportunities
Computational and structural biotechnology journal, 2020-01, Vol.18, p.2075-2080
2020
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Longitudinal Multi-omics and Microbiome Meta-analysis Identify an Asymptomatic Gingival State That Links Gingivitis, Periodontitis, and Aging
mBio, 2021-03, Vol.12 (2)
2021
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A Microbiome-Based Index for Assessing Skin Health and Treatment Effects for Atopic Dermatitis in Children
mSystems, 2019-08, Vol.4 (4)
2019
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Parallel‐Meta Suite: Interactive and rapid microbiome data analysis on multiple platforms
iMeta, 2022-03, Vol.1 (1), p.e1-n/a
2022
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Identifying and Predicting Novelty in Microbiome Studies
mBio, 2018-11, Vol.9 (6)
2018
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Multiple-Disease Detection and Classification across Cohorts via Microbiome Search
mSystems, 2020-03, Vol.5 (2)
2020
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Meta-QC-Chain： Comprehensive and Fast Quality Control Method for Metagenomic Data
Genomics, proteomics & bioinformatics, 2014-02, Vol.12 (1), p.52-56
2014
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A Scale-Free, Fully Connected Global Transition Network Underlies Known Microbiome Diversity
mSystems, 2021-08, Vol.6 (4), p.e0039421-e0039421
2021
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Effects of 60 days of 6° head-down bed rest on the composition and function of the human gut microbiota
iScience, 2023-05, Vol.26 (5), p.106615-106615, Article 106615
2023
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Single‐cell rapid identification, in situ viability and vitality profiling, and genome‐based source‐tracking for probiotics products
iMeta, 2023-08, Vol.2 (3), p.e117-n/a
2023
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Microbiome Search Engine 2: a Platform for Taxonomic and Functional Search of Global Microbiomes on the Whole-Microbiome Level
mSystems, 2021-01, Vol.6 (1)
2021
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Reply to Sun et al., "Identifying Composition Novelty in Microbiome Studies: Improvement of Prediction Accuracy"
mBio, 2019-08, Vol.10 (4)
2019
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Dynamic Meta-Storms enables comprehensive taxonomic and phylogenetic comparison of shotgun metagenomes at the species level
Bioinformatics, 2020-04, Vol.36 (7), p.2308-2310
2020
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GPU-Meta-Storms: computing the structure similarities among massive amount of microbial community samples using GPU
Bioinformatics, 2014-04, Vol.30 (7), p.1031-1033
2014
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Comprehensive understanding to the public health risk of environmental microbes via a microbiome-based index
Journal of genetics and genomics, 2022-07, Vol.49 (7), p.685-688
2022
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Hierarchical Meta-Storms enables comprehensive and rapid comparison of microbiome functional profiles on a large scale using hierarchical dissimilarity metrics and parallel computing
Bioinformatics advances, 2021, Vol.1 (1), p.vbab003-vbab003
2021
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Application of Meta-Mesh on the analysis of microbial communities from human associated-habitats
Quantitative biology, 2015-05, Vol.3 (1), p.4-18
2015
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Application of Meta-Mesh on the analysis of microbial communities from human associated-habitats
中国电气与电子工程前沿：英文版, 2015 (1), p.4-18
2015
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Forecasting hand-foot-and-mouth disease cases using wavelet-based SARIMA-NNAR hybrid model
PloS one, 2021-02, Vol.16 (2), p.e0246673-e0246673
2021
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Risk factors for lymph node metastasis and surgical methods in patients with early-stage peripheral lung adenocarcinoma presenting as ground glass opacity
Journal of cardiothoracic surgery, 2020-08, Vol.15 (1), p.121-121, Article 121
2020
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