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Real-time analysis of hospital length of stay in a mixed SARS-CoV-2 Omicron and Delta epidemic in New South Wales, Australia
BMC infectious diseases, 2023-01, Vol.23 (1), p.28-28, Article 28
2023
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ViQuaS: an improved reconstruction pipeline for viral quasispecies spectra generated by next-generation sequencing
Bioinformatics, 2015-03, Vol.31 (6), p.886-896
2015
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ENVirT: inference of ecological characteristics of viruses from metagenomic data
BMC bioinformatics, 2019-02, Vol.19 (Suppl 13), p.377-377, Article 377
2019
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Emergence of pertactin-deficient pertussis strains in Australia can be explained by models of vaccine escape
Epidemics, 2020-06, Vol.31, p.100388-100388, Article 100388
2020
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Assessing Species Diversity Using Metavirome Data: Methods and Challenges
Computational and structural biotechnology journal, 2017-01, Vol.15, p.447-455
2017
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Whole of population-based cohort study of recovery time from COVID-19 in New South Wales Australia
The Lancet regional health. Western Pacific, 2021-07, Vol.12, p.100193, Article 100193
2021
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472Long-term effectiveness of 3-dose primary course and 4-year booster dose of pertussis vaccine in Australia
International journal of epidemiology, 2021-09, Vol.50 (Supplement_1)
2021
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473Preventable pertussis burden in Australia within the first year of life by improving vaccination timeliness
International journal of epidemiology, 2021-09, Vol.50 (Supplement_1)
2021
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Estimating the excess burden of pertussis disease in Australia within the first year of life, that might have been prevented through timely vaccination
International journal of epidemiology, 2023-02, Vol.52 (1), p.250-259
2023
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Modelling the in-host dynamics of Neisseria gonorrhoeae infection
Pathogens and disease, 2019-02, Vol.77 (1)
2019
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Modelling the decline and future of hepatitis A transmission in Australia
Journal of viral hepatitis, 2019-01, Vol.26 (1), p.199-207
2019
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Quantifying the population effects of vaccination and migration on hepatitis A seroepidemiology in Australia
Vaccine, 2017-09, Vol.35 (39), p.5228-5234
2017
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Accurate reconstruction of viral quasispecies spectra through improved estimation of strain richness
BMC bioinformatics, 2015-12, Vol.16 Suppl 18 (S18), p.S3-S3, Article S3
2015
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Chapter 7 - Human Body to Water Reservoirs: Estimating Viral Population Characteristics Using High-Throughput Sequencing
Metagenomics, 2018, p.139-155
2018
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