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Author Correction: Chromatin lncRNA Platr10 controls stem cell pluripotency by coordinating an intrachromosomal regulatory network
Genome Biology, 2021-09, Vol.22 (1), p.1-272, Article 272
2021
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Chromatin lncRNA Platr10 controls stem cell pluripotency by coordinating an intrachromosomal regulatory network
Genome Biology, 2021-08, Vol.22 (1), p.233-29, Article 233
2021
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Finding steady states of large scale regulatory networks through partitioning
2010 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics (GENSIPS), 2010, p.1-4
2010
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Fine-scale chromatin interaction maps reveal the cis-regulatory landscape of human lincRNA genes
Nature methods, 2015-01, Vol.12 (1), p.71-78
2015
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HIDEN: Hierarchical decomposition of regulatory networks
BMC bioinformatics, 2012-09, Vol.13 (1), p.250-250, Article 250
2012
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Inferring gene functions from metabolic reactions
Proceedings 2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics (GENSIPS), 2012, p.159-163
2012
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Profiling the long noncoding RNA interaction network in the regulatory elements of target genes by chromatin in situ reverse transcription sequencing
Genome research, 2019-09, Vol.29 (9), p.1521-1532
2019
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Querying Large Biological Network Datasets
2013
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RINQ: Reference-based Indexing for Network Queries
Bioinformatics, 2011-07, Vol.27 (13), p.i149-i158
2011
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Topac: alignment of gene regulatory networks using topology-aware coloring
Journal of bioinformatics and computational biology, 2012-02, Vol.10 (1), p.1240001
2012
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Topologically associating domains are stable units of replication-timing regulation
Nature (London), 2014-11, Vol.515 (7527), p.402-405
2014
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Topology aware coloring of gene regulatory networks
Proceedings of the 2nd ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine, 2011, p.435-440
2011
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Using DNase Hi-C techniques to map global and local three-dimensional genome architecture at high resolution
Methods (San Diego, Calif.), 2018-06, Vol.142, p.59-73
2018
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