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EdgeCrafting: mining embedded, latent, nonlinear patterns to construct gene relationship networks
G3 : genes - genomes - genetics, 2022-04, Vol.12 (4)
2022
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RNAseq Analysis of the Response of Arabidopsis thaliana to Fractional Gravity Under Blue-Light Stimulation During Spaceflight
Frontiers in plant science, 2019-11, Vol.10, p.1529-1529
2019
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Generative adversarial networks applied to gene expression analysis: An interdisciplinary perspective
Computational and systems oncology, 2023-09, Vol.3 (3), p.n/a
2023
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A Medicago truncatula Autoregulation of Nodulation Mutant Transcriptome Analysis Reveals Disruption of the SUNN Pathway Causes Constitutive Expression Changes in Some Genes, but Overall Response to Rhizobia Resembles Wild-Type, Including Induction of TML1 and TML2
Current issues in molecular biology, 2023-05, Vol.45 (6), p.4612-4631
2023
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A systems-genetics approach and data mining tool to assist in the discovery of genes underlying complex traits in Oryza sativa
PloS one, 2013-07, Vol.8 (7), p.e68551-e68551
2013
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Time Series Transcriptome Analysis in Medicago truncatula Shoot and Root Tissue During Early Nodulation
Frontiers in plant science, 2022-04, Vol.13, p.861639-861639
2022
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Widespread Genotype-Phenotype Correlations in Intellectual Disability
Frontiers in psychiatry, 2018-10, Vol.9, p.535-535
2018
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Identifying Temporally Regulated Root Nodulation Biomarkers Using Time Series Gene Co-Expression Network Analysis
Frontiers in plant science, 2019-10, Vol.10, p.1409-1409
2019
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Analysis of Crystallinity Index and Hydrolysis Rates in the Bioenergy Crop Sorghum bicolor
Bioenergy research, 2012-06, Vol.5 (2), p.387-397
2012
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Quantitative models of hydrolysis conversion efficiency and biomass crystallinity index for plant breeding
Plant breeding, 2013-06, Vol.132 (3), p.252-258
2013
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Discovery of eQTL Alleles Associated with Autism Spectrum Disorder: A Case–Control Study
Journal of autism and developmental disorders, 2023-09, Vol.53 (9), p.3595-3612
2023
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Autism risk genes are evolutionarily ancient and maintain a unique feature landscape that echoes their function
Autism research, 2019-06, Vol.12 (6), p.860-869
2019
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Conserved Non-Coding Sequences are Associated with Rates of mRNA Decay in Arabidopsis
Frontiers in plant science, 2013-05, Vol.4, p.129-129
2013
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A Systems-Genetics Approach and Data Mining Tool to Assist in the Discovery of Genes Underlying Complex Traits in Oryza sativa. e68551
PloS one, 2013-07, Vol.8 (7)
2013
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Conserved noncoding sequences are associated with rates of mRNA decay in Arabidopsis
Frontiers in plant science, 2013-05, Vol.4
2013
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Bioenergy grass feedstock: current options and prospects for trait improvement using emerging genetic, genomic, and systems biology toolkits
Biotechnology for biofuels, 2012-11, Vol.5 (1), p.80
2012
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WiP: AABAC - Automated Attribute Based Access Control for Genomics Data
Proceedings of the 27th ACM on Symposium on Access Control Models and Technologies, 2022, p.217-222
2022
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Designing Hydra with Centralized versus Decentralized Control: A Comparative Study
Proceedings of the Interdisciplinary Workshop on (de) Centralization in the Internet, 2021, p.4-10
2021
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