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HERB: a high-throughput experiment- and reference-guided database of traditional Chinese medicine
Nucleic acids research, 2021-01, Vol.49 (D1), p.D1197
2021
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SymMap: an integrative database of traditional Chinese medicine enhanced by symptom mapping
Nucleic acids research, 2019-01, Vol.47 (D1), p.D1110
2019
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NONCODEV6: an updated database dedicated to long non-coding RNA annotation in both animals and plants
Nucleic acids research, 2021-01, Vol.49 (D1), p.D165
2021
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NONCODE 2016: an informative and valuable data source of long non-coding RNAs
Nucleic acids research, 2016-01, Vol.44 (D1), p.D203
2016
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NONCODEV5: a comprehensive annotation database for long non-coding RNAs
Nucleic acids research, 2018-01, Vol.46 (D1), p.D308
2018
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Computational Approaches and Challenges in Spatial Transcriptomics
Genomics, proteomics & bioinformatics, 2023-02, Vol.21 (1), p.24-47
2023
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A novel variable neighborhood search approach for cell clustering for spatial transcriptomics
GigaByte (Hong Kong, China), 2024-02, Vol.2024, p.gigabyte109-gigabyte109
2024
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BatchEval Pipeline: batch effect evaluation workflow for multiple datasets joint analysis
GigaByte (Hong Kong, China), 2024-02, Vol.2024, p.gigabyte108-gigabyte108
2024
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Evolutionary annotation of conserved long non-coding RNAs in major mammalian species
Science China. Life sciences, 2015-08, Vol.58 (8), p.787-798
2015
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Comprehensive Characterization of the RNA Editomes in Cancer Development and Progression
Frontiers in genetics, 2018-01, Vol.8, p.230-230
2018
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Generating single-cell gene expression profiles for high-resolution spatial transcriptomics based on cell boundary images
GigaByte (Hong Kong, China), 2024-02, Vol.2024, p.gigabyte110-gigabyte110
2024
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SAW: an efficient and accurate data analysis workflow for Stereo-seq spatial transcriptomics
GigaByte (Hong Kong, China), 2024-02, Vol.2024, p.gigabyte111-gigabyte111
2024
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Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020
Nucleic acids research, 2020-01, Vol.48 (D1), p.D24
2020
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TcoFBase: a comprehensive database for decoding the regulatory transcription co-factors in human and mouse
Nucleic acids research, 2022-01, Vol.50 (D1), p.D391
2022
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Identification and function annotation of long intervening noncoding RNAs
Briefings in bioinformatics, 2017-09, Vol.18 (5), p.789-797
2017
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VarBen: Generating in Silico Reference Data Sets for Clinical Next-Generation Sequencing Bioinformatics Pipeline Evaluation
The Journal of molecular diagnostics : JMD, 2021-03, Vol.23 (3), p.285-299
2021
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EAGS: efficient and adaptive Gaussian smoothing applied to high-resolved spatial transcriptomics
Gigascience, 2024-01, Vol.13 (1)
2024
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VarBen
The Journal of molecular diagnostics : JMD, 2021-03, Vol.23 (3), p.285-299
2021
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Deciphering spatial domains from spatially resolved transcriptomics with Siamese graph autoencoder
Gigascience, 2024-01, Vol.13 (1)
2024
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The long non-coding RNA NONHSAG026900 predicts prognosis as a favorable biomarker in patients with diffuse large B-cell lymphoma
Oncotarget, 2017-05, Vol.8 (21), p.34374-34386
2017
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Using the NONCODE Database Resource
Current Protocols in Bioinformatics, 2017-06, Vol.58 (1), p.12.16.1-12.16.19
2017
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