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Myc and Dnmt1 impede the pluripotent to totipotent state transition in embryonic stem cells
Nature cell biology, 2019-07, Vol.21 (7), p.835-844
2019
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Cell type-specific transcriptional programs in mouse prefrontal cortex during adolescence and addiction
Nature communications, 2019-09, Vol.10 (1), p.4169-18, Article 4169
2019
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FIND: difFerential chromatin INteractions Detection using a spatial Poisson process
Genome research, 2018-03, Vol.28 (3), p.412-422
2018
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A transcriptional roadmap for 2C-like-to-pluripotent state transition
Science advances, 2020-05, Vol.6 (22), p.eaay5181-eaay5181
2020
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Auxin-inducible degron 2 system deciphers functions of CTCF domains in transcriptional regulation
Genome Biology, 2023-01, Vol.24 (1), p.14-30, Article 14
2023
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Acute depletion of CTCF rewires genome-wide chromatin accessibility
Genome Biology, 2021-08, Vol.22 (1), p.244-25, Article 244
2021
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Interrogating bromodomain inhibitor resistance in KMT2A-rearranged leukemia through combinatorial CRISPR screens
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2023-04, Vol.120 (16), p.e2220134120-e2220134120
2023
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Developing bioimaging and quantitative methods to study 3D genome
Quantitative biology, 2016-05, Vol.4 (2), p.129-147
2016
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SNIP1 and PRC2 coordinate cell fates of neural progenitors during brain development
Nature communications, 2023-08, Vol.14 (1), p.4754-18, Article 4754
2023
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Reprogramming of Chromatin Accessibility in Somatic Cell Nuclear Transfer Is DNA Replication Independent
Cell reports (Cambridge), 2018-05, Vol.23 (7), p.1939-1947
2018
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3CPET: finding co-factor complexes from ChIA-PET data using a hierarchical Dirichlet process
Genome Biology, 2015-12, Vol.16 (1), p.288-288, Article 288
2015
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Alterations of specific chromatin conformation affect ATRA-induced leukemia cell differentiation
Cell death & disease, 2018-02, Vol.9 (2), p.200-15, Article 200
2018
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HiC-3DViewer: a new tool to visualize Hi-C data in 3D space
Quantitative biology, 2017-06, Vol.5 (2), p.183-190
2017
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Author Correction: Distinct dynamics and functions of H2AK119ub1 and H3K27me3 in mouse preimplantation embryos
Nature genetics, 2021-06, Vol.53 (6), p.936-936
2021
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eccDNAs are apoptotic products with high innate immunostimulatory activity
Nature (London), 2021-11, Vol.599 (7884), p.308-314
2021
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Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
Nature neuroscience, 2023-11, Vol.26 (11), p.1880-1893
2023
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Antitumor progenitor exhausted CD8+ T cells are sustained by TCR engagement
Nature immunology, 2024-05
2024
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Dynamic Foxp3–chromatin interaction controls tunable Treg cell function
The Journal of experimental medicine, 2024-09, Vol.221 (9)
2024
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Phosphorylation of the DNA damage repair factor 53BP1 by ATM kinase controls neurodevelopmental programs in cortical brain organoids
PLoS biology, 2024-09, Vol.22 (9), p.e3002760
2024
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