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DeepViral: prediction of novel virus–host interactions from protein sequences and infectious disease phenotypes
Bioinformatics (Oxford, England), 2021-09, Vol.37 (17), p.2722-2729
2021
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Computational Analysis of SARS-CoV-2 and SARS-Like Coronavirus Diversity in Human, Bat and Pangolin Populations
Viruses, 2020-12, Vol.13 (1), p.49
2020
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No one tool to rule them all: prokaryotic gene prediction tool annotations are highly dependent on the organism of study
Bioinformatics (Oxford, England), 2022-02, Vol.38 (5), p.1198-1207
2022
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Accessory genes define species-specific routes to antibiotic resistance
Life science alliance, 2024-04, Vol.7 (4), p.e202302420
2024
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O04 Understanding the key role of accessory genes in AMR phenotype through interpretable machine learning techniques
JAC-antimicrobial resistance, 2023-06, Vol.5 (Supplement_2)
2023
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Automated pseudogene detection reveals insights into historical gene sharing dynamics in prokaryotes
Access microbiology, 2022-05, Vol.4 (5)
2022
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