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Coupling Molecular Dynamics and Deep Learning to Mine Protein Conformational Space
Structure (London), 2019-06, Vol.27 (6), p.1034-1040.e3
2019
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Collision Cross Sections for Structural Proteomics
Structure (London), 2015-04, Vol.23 (4), p.791-799
2015
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Mineral surface chemistry control for origin of prebiotic peptides
Nature communications, 2017-12, Vol.8 (1), p.2033-9, Article 2033
2017
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A subset of annular lipids is linked to the flippase activity of an ABC transporter
Nature chemistry, 2015-03, Vol.7 (3), p.255
2015
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Molecular assembly of the aerolysin pore reveals a swirling membrane-insertion mechanism
Nature chemical biology, 2013-10, Vol.9 (10), p.623
2013
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Macromolecular Symmetric Assembly Prediction Using Swarm Intelligence Dynamic Modeling
Structure (London), 2013-07, Vol.21 (7), p.1097-1106
2013
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Accommodating Protein Dynamics in the Modeling of Chemical Crosslinks
Structure (London), 2017-11, Vol.25 (11), p.1751-1757.e5
2017
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Deep Learning Protein Conformational Space with Convolutions and Latent Interpolations
Physical review. X, 2021-03, Vol.11 (1), p.011052, Article 011052
2021
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Integrating mass spectrometry with MD simulations reveals the role of lipids in Na + /H + antiporters
Nature communications, 2017-01, Vol.8 (1), p.13993-13993, Article 13993
2017
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Automatic Assignment of Methyl-NMR Spectra of Supramolecular Machines Using Graph Theory
Journal of the American Chemical Society, 2017-07, Vol.139 (28), p.9523-9533
2017
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Computational Strategies and Challenges for Using Native Ion Mobility Mass Spectrometry in Biophysics and Structural Biology
Analytical chemistry (Washington), 2020-08, Vol.92 (16), p.10872-10880
2020
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The epilepsy-associated protein TBC1D24 is required for normal development, survival and vesicle trafficking in mammalian neurons
Human molecular genetics, 2019-02, Vol.28 (4), p.584-597
2019
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Software Requirements for the Analysis and Interpretation of Native Ion Mobility Mass Spectrometry Data
Analytical chemistry (Washington), 2020-08, Vol.92 (16), p.10881-10890
2020
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Dual chaperone role of the C-terminal propeptide in folding and oligomerization of the pore-forming toxin aerolysin
PLoS pathogens, 2011-07, Vol.7 (7), p.e1002135-e1002135
2011
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  • BibTeX
Understanding surface interactions in aqueous miscible organic solvent treated layered double hydroxides
RSC advances, 2017-01, Vol.7 (9), p.576-583
2017
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Allophycocyanin A is a carbon dioxide receptor in the cyanobacterial phycobilisome
Nature communications, 2022-09, Vol.13 (1), p.5289-5289, Article 5289
2022
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  • BibTeX
In situ structural analysis of the Yersinia enterocolitica injectisome
eLife, 2013-07, Vol.2, p.e00792-e00792
2013
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  • BibTeX
Electrostatic-Consistent Coarse-Grained Potentials for Molecular Simulations of Proteins
Journal of chemical theory and computation, 2013-08, Vol.9 (8), p.3515-3526
2013
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  • BibTeX
Disentangling constraints using viability evolution principles in integrative modeling of macromolecular assemblies
Scientific reports, 2017-03, Vol.7 (1), p.235-235, Article 235
2017
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  • BibTeX
On the Effect of Sphere-Overlap on Super Coarse-Grained Models of Protein Assemblies
Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2019-01, Vol.30 (1), p.113-117
2019
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Membrane proteins bind lipids selectively to modulate their structure and function
Nature (London), 2014-06, Vol.510 (7503), p.172-175
2014
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Identification of Graphene Dispersion Agents through Molecular Fingerprints
ACS nano, 2022-10, Vol.16 (10), p.16109-16117
2022
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Dimer interface of bovine cytochrome c oxidase is influenced by local posttranslational modifications and lipid binding
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2016-07, Vol.113 (29), p.8230-8235
2016
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Cryo‐EM structure of the octameric pore of Clostridium perfringens β‐toxin
EMBO reports, 2022-12, Vol.23 (12), p.e54856-n/a
2022
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It takes a dimer to tango: Oligomeric small heat shock proteins dissociate to capture substrate
The Journal of biological chemistry, 2018-12, Vol.293 (51), p.19511-19521
2018
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