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Chromosome evolution at the origin of the ancestral vertebrate genome
Genome Biology, 2018-10, Vol.19 (1), p.166-15, Article 166
2018
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Genomicus 2018: karyotype evolutionary trees and on-the-fly synteny computing
Nucleic acids research, 2018-01, Vol.46 (D1), p.D816-D822
2018
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Genomicus update 2015: KaryoView and MatrixView provide a genome-wide perspective to multispecies comparative genomics
Nucleic acids research, 2015-01, Vol.43 (Database issue), p.D682-D689
2015
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Genomicus in 2022: comparative tools for thousands of genomes and reconstructed ancestors
Nucleic acids research, 2022-01, Vol.50 (D1), p.D1025-D1031
2022
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GC content shapes mRNA storage and decay in human cells
eLife, 2019-12, Vol.8
2019
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Signaling Switch of the Axon Guidance Receptor Robo3 during Vertebrate Evolution
Neuron (Cambridge, Mass.), 2014-12, Vol.84 (6), p.1258-1272
2014
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Classification of non-coding variants with high pathogenic impact
PLoS genetics, 2022-04, Vol.18 (4), p.e1010191-e1010191
2022
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ANISEED 2019: 4D exploration of genetic data for an extended range of tunicates
Nucleic acids research, 2020-01, Vol.48 (D1), p.D668
2020
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Genomicus: a database and a browser to study gene synteny in modern and ancestral genomes
Bioinformatics, 2010-04, Vol.26 (8), p.1119-1121
2010
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CLIP-seq of eIF4AIII reveals transcriptome-wide mapping of the human exon junction complex
Nature structural & molecular biology, 2012-11, Vol.19 (11), p.1124-1131
2012
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The 3D Organization of Chromatin Explains Evolutionary Fragile Genomic Regions
Cell reports (Cambridge), 2015-03, Vol.10 (11), p.1913-1924
2015
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Comparative epigenomics in the Brassicaceae reveals two evolutionarily conserved modes of PRC2-mediated gene regulation
Genome Biology, 2017-10, Vol.18 (1), p.207-207, Article 207
2017
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Gene loss and evolutionary rates following whole-genome duplication in teleost fishes
Molecular biology and evolution, 2006-09, Vol.23 (9), p.1808-1816
2006
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High precision detection of conserved segments from synteny blocks
PloS one, 2017-07, Vol.12 (7), p.e0180198
2017
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Human and non-human primate genomes share hotspots of positive selection
PLoS genetics, 2010-02, Vol.6 (2), p.e1000840-e1000840
2010
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Genomicus: five genome browsers for comparative genomics in eukaryota
Nucleic acids research, 2013-01, Vol.41 (Database issue), p.D700-D705
2013
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Identification and functional modelling of plausibly causative cis-regulatory variants in a highly-selected cohort with X-linked intellectual disability
PloS one, 2021-08, Vol.16 (8), p.e0256181-e0256181
2021
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Fish genomics and biology
Genome research, 2005-12, Vol.15 (12), p.1675-1682
2005
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The loss of adipokine genes in the chicken genome and implications for insulin metabolism
Molecular biology and evolution, 2014-10, Vol.31 (10), p.2637-2646
2014
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Conserved Small Nucleotidic Elements at the Origin of Concerted piRNA Biogenesis from Genes and lncRNAs
Cells (Basel, Switzerland), 2020-06, Vol.9 (6), p.1491
2020
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Preventing dangerous nonsense: selection for robustness to transcriptional error in human genes
PLoS genetics, 2011-10, Vol.7 (10), p.e1002276-e1002276
2011
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SCORPiOs, a Novel Method to Reconstruct Gene Phylogenies in the Context of a Known WGD Event
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2023, Vol.2545, p.155
2023
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Evolution is not Uniform Along Coding Sequences
Molecular biology and evolution, 2023-03, Vol.40 (3)
2023
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Enhancer-gene maps in the human and zebrafish genomes using evolutionary linkage conservation
Nucleic acids research, 2020-03, Vol.48 (5), p.2357-2371
2020
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Synteny-Guided Resolution of Gene Trees Clarifies the Functional Impact of Whole-Genome Duplications
Molecular biology and evolution, 2020-11, Vol.37 (11), p.3324-3337
2020
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