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De novo protein structure prediction using ultra-fast molecular dynamics simulation
PloS one, 2018-11, Vol.13 (11), p.e0205819-e0205819
2018
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Sibe: a computation tool to apply protein sequence statistics to predict folding and design in silico
BMC bioinformatics, 2019-09, Vol.20 (1), p.455-455, Article 455
2019
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Adaptive firefly algorithm: parameter analysis and its application
PloS one, 2014-11, Vol.9 (11), p.e112634-e112634
2014
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Accurate prediction of protein torsion angles using evolutionary signatures and recurrent neural network
Scientific reports, 2021-10, Vol.11 (1), p.21033-21033, Article 21033
2021
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Leri: A web-server for identifying protein functional networks from evolutionary couplings
Computational and structural biotechnology journal, 2021-01, Vol.19, p.3556-3563
2021
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Csf1: A Putative Lipid Transport Protein Required for Homeoviscous Adaptation of the Lipidome
Contact, 2022-01, Vol.5, p.251525642211019
2022
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OptiFel: A Convergent Heterogeneous Particle Swarm Optimization Algorithm for Takagi-Sugeno Fuzzy Modeling
IEEE transactions on fuzzy systems, 2014-08, Vol.22 (4), p.919-933
2014
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Parameter estimation of Takagi–Sugeno fuzzy system using heterogeneous cuckoo search algorithm
Neurocomputing (Amsterdam), 2015-03, Vol.151, p.1332-1342
2015
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Rewiring phospholipid biosynthesis reveals resilience to membrane perturbations and uncovers regulators of lipid homeostasis
The EMBO journal, 2022-04, Vol.41 (7), p.e109998-n/a
2022
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A Nonhomogeneous Cuckoo Search Algorithm Based on Quantum Mechanism for Real Parameter Optimization
IEEE transactions on cybernetics, 2017-02, Vol.47 (2), p.391-402
2017
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Shared structural features of Miro binding control mitochondrial homeostasis
The EMBO journal, 2024-02, Vol.43 (4), p.595-614
2024
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Protein folds recognized by an intelligent predictor based-on evolutionary and structural information
Journal of computational chemistry, 2016-02, Vol.37 (4), p.426-436
2016
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Modeling nonlinear dynamic biological systems with human-readable fuzzy rules optimized by convergent heterogeneous particle swarm
European journal of operational research, 2015-12, Vol.247 (2), p.349-358
2015
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Hierarchical particle swarm optimizer for minimizing the non-convex potential energy of molecular structure
Journal of molecular graphics & modelling, 2014-11, Vol.54, p.114-122
2014
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A supervised particle swarm algorithm for real-parameter optimization
Applied intelligence (Dordrecht, Netherlands), 2015-12, Vol.43 (4), p.825-839
2015
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Csf1: A Putative Lipid Transport Protein Required for Homeoviscous Adaptation of the Lipidome
Contact, 2022-01, Vol.5, p.25152564221101974
2022
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