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Combining LOPIT with differential ultracentrifugation for high-resolution spatial proteomics
Nature communications, 2019-01, Vol.10 (1), p.331-331, Article 331
2019
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A draft map of the mouse pluripotent stem cell spatial proteome
Nature communications, 2016-01, Vol.7 (1), p.8992-8992, Article 9992
2016
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Proteome Mapping of a Cyanobacterium Reveals Distinct Compartment Organization and Cell-Dispersed Metabolism
Plant physiology (Bethesda), 2019-12, Vol.181 (4), p.1721-1738
2019
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Mapping diversity in African trypanosomes using high resolution spatial proteomics
Nature communications, 2023-07, Vol.14 (1), p.4401-4401, Article 4401
2023
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Spatiotemporal proteomic profiling of the pro-inflammatory response to lipopolysaccharide in the THP-1 human leukaemia cell line
Nature communications, 2021-10, Vol.12 (1), p.5773-5773, Article 5773
2021
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Spatial proteomics defines the content of trafficking vesicles captured by golgin tethers
Nature communications, 2020-11, Vol.11 (1), p.5987-5987, Article 5987
2020
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Inferring differential subcellular localisation in comparative spatial proteomics using BANDLE
Nature communications, 2022-10, Vol.13 (1), p.5948-5948, Article 5948
2022
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Deciphering Thylakoid Sub-compartments using a Mass Spectrometry-based Approach
Molecular & cellular proteomics, 2014-08, Vol.13 (8), p.2147-2167
2014
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Learning from Heterogeneous Data Sources: An Application in Spatial Proteomics
PLoS computational biology, 2016-05, Vol.12 (5), p.e1004920-e1004920
2016
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A Bioconductor workflow for processing, evaluating, and interpreting expression proteomics data
F1000 research, 2023, Vol.12, p.1402-1402
2023
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A Comprehensive Subcellular Atlas of the Toxoplasma Proteome via hyperLOPIT Provides Spatial Context for Protein Functions
Cell host & microbe, 2020-11, Vol.28 (5), p.752-766.e9
2020
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Assessing sub-cellular resolution in spatial proteomics experiments
Current opinion in chemical biology, 2019-02, Vol.48, p.123-149
2019
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CFTR Rescue by Lumacaftor (VX-809) Induces an Extensive Reorganization of Mitochondria in the Cystic Fibrosis Bronchial Epithelium
Cells (Basel, Switzerland), 2022-06, Vol.11 (12), p.1938
2022
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A Bioconductor workflow for the Bayesian analysis of spatial proteomics [version 1; peer review: 1 approved, 2 approved with reservations]
F1000 research, 2019, Vol.8, p.446-446
2019
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Mass-spectrometry-based spatial proteomics data analysis using pRoloc and pRolocdata
Bioinformatics, 2014-05, Vol.30 (9), p.1322-1324
2014
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A Bioconductor workflow for processing and analysing spatial proteomics data [version 2; peer review: 2 approved]
F1000 research, 2016-01, Vol.5, p.2926-2926
2016
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Visualization of proteomics data using R and Bioconductor
Proteomics (Weinheim), 2015-04, Vol.15 (8), p.1375-1389
2015
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Using hyperLOPIT to perform high-resolution mapping of the spatial proteome
Nature protocols, 2017-06, Vol.12 (6), p.1110-1135
2017
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System-wide analysis of RNA and protein subcellular localization dynamics
Nature methods, 2024-01, Vol.21 (1), p.60
2024
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The subcellular organisation of Saccharomyces cerevisiae
Current opinion in chemical biology, 2019-02, Vol.48, p.86-95
2019
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Identification of Trans-Golgi Network Proteins in Arabidopsis thaliana Root Tissue
Journal of proteome research, 2014-02, Vol.13 (2), p.763-776
2014
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Localization of Organelle Proteins by Isotope Tagging: Current status and potential applications in drug discovery research
Drug discovery today. Technologies, 2021-12, Vol.39, p.57-67
2021
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A Foundation for Reliable Spatial Proteomics Data Analysis
Molecular & cellular proteomics, 2014-08, Vol.13 (8), p.1937-1952
2014
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A subcellular map of the human proteome
Science (American Association for the Advancement of Science), 2017-05, Vol.356 (6340), p.820-820
2017
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A Bioconductor workflow for processing and analysing spatial proteomics data [version 1; peer review: 1 approved, 1 approved with reservations]
F1000 research, 2016, Vol.5, p.2926
2016
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