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DNAscent v2: detecting replication forks in nanopore sequencing data with deep learning
BMC genomics, 2021-06, Vol.22 (1), p.1-430, Article 430
2021
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The Beacon Calculus: A formal method for the flexible and concise modelling of biological systems
PLoS computational biology, 2020-03, Vol.16 (3), p.e1007651-e1007651
2020
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Capturing the dynamics of genome replication on individual ultra-long nanopore sequence reads
Nature methods, 2019-05, Vol.16 (5), p.429-436
2019
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A genome-wide map of DNA replication at single-molecule resolution in the malaria parasite Plasmodium falciparum
Nucleic acids research, 2023-04, Vol.51 (6), p.2709-2724
2023
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Replication stress generates distinctive landscapes of DNA copy number alterations and chromosome scale losses
Genome Biology, 2022-10, Vol.23 (1), p.223-24, Article 223
2022
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Mathematical modelling of a hypoxia-regulated oncolytic virus delivered by tumour-associated macrophages
Journal of theoretical biology, 2019-01, Vol.461, p.102-116
2019
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An Autonomous Oscillation Times and Executes Centriole Biogenesis
Cell, 2020-06, Vol.181 (7), p.1566-1581.e27
2020
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The Formal Language and Design Principles of Autonomous DNA Walker Circuits
ACS synthetic biology, 2016-08, Vol.5 (8), p.878-884
2016
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Lactase persistence and lipid pathway selection in the Maasai
PloS one, 2012-09, Vol.7 (9), p.e44751-e44751
2012
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Computation by Origami-Templated Dna Walkers
2016
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Automated Design and Verification of Localized DNA Computation Circuits
DNA Computing and Molecular Programming, 2015, Vol.9211, p.168-180
2015
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International Multicenter Intraductal Papillary Mucinous Neoplasm (IPMN) Registry: Role of EUS-FNA Cytology, CEA, and Amylase in the Diagnosis of IPMNs: 1473
The American journal of gastroenterology, 2014-10, Vol.109, p.S664
2014
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Risk Factors for Malignant Progression of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms (IPMN): An International Registry Cohort: 1466
The American journal of gastroenterology, 2014-10, Vol.109, p.S664
2014
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Su1492 Risk Factors for Malignant Progression of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms (IPMN): An International Registry Cohort
Gastroenterology (New York, N.Y. 1943), 2014-05, Vol.146 (5), p.S-483-S-483
2014
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Design space exploration of present implementations for FPGAS
2009 5th Southern Conference on Programmable Logic (SPL), 2009, p.141-145
2009
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